第一部分 ZP4基因单核苷酸多态性与中国汉族人群原发性开角型青光眼关联研究 第二部分 一个遗传性压力易感性周围神经病家系候选基因PMP22筛查研究

来源 :西南医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lsdkj
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目的:迄今为止,基于全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)发现了数十个遗传基因或位点与原发性开角型青光眼(Primary Open-angle Glaucoma,POAG)的发病相关。其中小梁网诱导性糖皮质激素反应蛋白基因(Myocilin,MYOC)、视神经病变诱导反应蛋白基因(Optineurin,OPTN)、色氨酸-天门冬氨酸重复序列36基因(WD40-repeat 36,WDR36)和神经营养因子(Neurotrophin-4,NTF4)等被鉴定为POAG的致病基因。近来,研究发现透明带糖蛋白基因(Zona Pellucida Glycoprotein 4,ZP4)单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)位点rs547984、rs540782、rs693421和rs2499601与POAG相关联(Nakano M等,2009;Kim K等,2014)。但在其他人群未得到有关联的证据。本研究在中国汉族人群验证ZP4基因SNPs与POAG的关联性。方法:本研究纳入336例POAG及768例正常对照进行病例对照研究;采用单碱基延伸法(SNa Pshot)对ZP4基因的SNPs位点rs547984、rs540782、rs693421、rs2499601进行基因分型。统计学分析方法(SPSS22.0)包括:采用卡方检验分析等位基因、基因型频率分布及分析其显性、隐性遗传模型;采用Logistic回归校正性别、年龄的差异;采用Bonferroni方法进行P值多重校正;采用Haploview4.2(Broad Institute,Cambridge,MA)分析连锁不平衡(Linkage Disequilibrium,LD)和单倍体型结构。结果:ZP4基因4个SNPs位点的基因型频率在病例组与对照组的分布均符合HWE(P>0.05),说明研究对象具有群体代表性。本研究未发现ZP4基因的这4个SNPs位点等位基因分布与POAG的发病相关。进一步应用显性与隐性遗传模型进行分析这些SNPs位点与POAG的关系,结果显示病例组及正常对照组的差异无统计学意义(P>0.05)。进一步分析单倍体型,发现这4个SNPs产生的GGAG单倍体型在病例组与对照组之间的分布有统计学差异(P<0.05),为风险单倍体型;携有GGAG单倍体型的个体患POAG的风险将增加2.935倍。结论:本研究对336例POAG患者和768例对照进行病例对照研究,验证ZP4基因SNPs位点rs547984、rs540782、rs693421及rs2499601的多态性与POAG的关系,结果表明ZP4基因SNPs位点rs547984、rs540782、rs693421及rs2499601与中国汉族人群POAG发病可能无关联性。目的:针对一个遗传性压力易感性周围神经病(hereditary neuropathy with liability to pressure palsy,HNPP)家系,进行周围神经髓鞘蛋白22(peripheral myelin protein22,PMP22)基因缺陷筛查,确定PMP22基因是否为该先证者的遗传病因。方法:对先证者及未患病家系成员采用(1)PCR结合Sanger测序,筛查PMP22基因2-5号外显子和5’-UTR侧翼区的点突变;(2)采用多重连接依赖性探针扩增技术(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)检测PMP22基因大片段重复或缺失突变。结果:(1)直接Sanger法测序未检测到PMP22基因外显子及其侧翼区点突变;(2)MLPA检测到先证者PMP22外显子相对峰面积比值小于0.7,提示相对应的17p11.2包含PMP22基因在内的片段发生杂合缺失。结论:研究表明17p11.2包含PMP22基因在内的大片段缺失是该HNPP先证者的分子诊断依据。
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