南板蓝根的化学成分及基于量子化学计算的结构鉴定

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天然产物及其衍生物是发现先导化合物和新药创制的重要途径之一,而活性天然产物的发现和结构鉴定工作是重中之重,也是阐明天然产物构效关系和研发新药的关键前提。本文主要围绕天然产物的分离和结构鉴定两大方面展开,以中药南板蓝根(Baphicacanthis cusiae Rhizoma et Radix)为研究对象,运用多种分离手段从中获得新颖结构,研究结果进一步丰富了南板蓝根的化学成分。运用量子化学计算手段,对多种新颖天然产物的NMR、ECD和OR进行了理论计算,为确证其相对或绝对构型提供强有力的支撑,并在此基础之上开发了一款自动化处理Gaussian计算结果并模拟ECD曲线的软件,简化了ECD计算结果的处理过程。采用大孔树脂、硅胶、RP-C18、Sephadex LH-20凝胶等现代填料柱色谱和HPLC分离技术从南板蓝根的95%乙醇提取物中分离得到14个化合物,包括5个苯乙醇苷类、5个苯丙素类、1个羽扇豆烷型三萜、2个生物碱、1个黄酮。其中化合物1为一个新的苯乙醇苷类化合物,除了化合物12,13,14外,其余10个化合物均为首次从南板蓝根中分离得到。天然产物具有复杂多变的结构,且一般富含多个手性中心,对其进行结构鉴定一直是复杂的过程,存在许多难点,确定其绝对构型就是其中之一。目前确定手性分子绝对构型的方法有:手性有机合成;基于NMR的mosher法或位移试剂法;X-射线单晶衍射;手性光谱学方法等。在这些方法中,手性光谱学方法对于样品的纯度、能够结晶等条件要求不高,测量所需样品量少,测量之后样品可回收,因此得到了广泛地应用。随着计算机技术的迅速发展以及密度泛函理论(Density Functional Theory,DFT)和含时密度泛函理论(TimeDependent Density Functional Theory,TDDFT)的成熟,量子化学计算已经逐步取代传统经验规律,成为确定天然产物构型鉴定的有效流行技术。本文对运用量子化学计算方法用于确定天然产物相对构型、绝对构型的方法进行了梳理,进而分别研究并解决了多种天然产物的构型问题,包括:(1)三项NMR计算实例,以确定化合物的相对构型。运用密度泛函理论的方法对三个9,11-seco四环三萜化合物各碳氢原子的化学位移进行计算,通过将理论值和实测值进行DP4+可行性分析确定了这三个新化合物的相对构型,并且之前结构被错误报道的化合物euphorol J被修正为化合物15;(2)十六项电子圆二色谱(ECD)计算实例,以确定化合物的绝对构型。着重描述了运用含时密度泛函理论方法对其中的八个新化合物(五对苯并呋喃二聚体、两个9,11-seco四环三萜化合物和一个大环超分子手性化合物)的ECD进行计算模拟;(3)五项旋光计算研究实例,以辅助确定化合物绝对构型。运用密度泛函理论的方法计算了五对苯并呋喃二聚体的OR值,将理论OR值和实测OR值对比,进一步辅助确定了这五对苯并呋喃二聚体的绝对构型。在大量实践和阅读文献的基础上,本文对ECD曲线的模拟方法、ECD计算结果的评价标准进行了全面总结。此外,为了提升数据处理和作图的效率,基于python语言开发了一款自动化处理高斯ECD计算结果、模拟ECD曲线的软件,方便了计算ECD的数据处理和结果评价。
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