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本文是在国家自然科学基金项目“复杂体系计算模拟程序设计和相关的基础理论”的支持下完成的。计算机软硬件的飞速发展,已使得科学计算跻身于理论和实验中重要的一个领域,构成了当今科学研究的重要基础。由于化学分子,尤其是生物分子的化学结构本身的复杂性,计算机图形显示在近年来更是在此领域发挥了巨大作用。国际上在此方面起步较早,已有较为成熟的商用软件,并各有千秋。为填补国内此项空白,我们自主设计开发了大型化学和生物分子结构和性质模拟软件程序包SimuPac。
SimuPac软件可方便地构建和图形显示化学和生物分子的立体结构,调用我们自主开发的多种量子化学计算模块对构建的分子的多种性质进行不同等级的计算,还可连接调用国际上通用的商用计算软件。对所有的计算结果所得多种性质进行图形显示和分析。
本文主要集中于SimuPac软件包界面部分的设计和分析。第一部分对与量子化学计算相关的概念以及量子化学计算软件的一些概念做了介绍,并对相关的软件做了简要的说明。第二部分和第三部分则集中对SimuPac软件的一些要求做出了分析。第四部分则主要对SimuPac界面部分所主要涉及到的模块给出了说明和分析,并对一些算法和接口做了说明。第五部分探讨了在SimuPac开发过程中的过程和质量控制方面的内容。第六部分简要说明了本软件存在的一些优点和不足。