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小麦条锈病是由小麦条锈菌引起的小麦叶部病害，该病害发生面积广，流行频率高，危害严重。我国小麦条锈病流行体系是一个相对独立的体系。目前，防治小麦条锈病主要是使用抗病品种和化学防治，但不论是利用抗病品种还是化学防治，都必须快速及时了解小麦条锈菌生理小种的动态或毒性变异趋势。关于体细胞重组(异核作用)前人有了一些初步研究，但到底是否可通过体细胞重组导致毒性变异没有确切的理论依据。本研究利用10个菌系以及白化菌进行了体细胞重组产生新菌系的筛选。并利用24对SSR引物对异核菌系和我国小麦条锈菌主要流行小种进行了DNA多态性分析。 1．在进行异核菌系筛选过程中，有四个组合筛选出了异核菌系。即1号菌系、2号菌系、3号菌系、4号菌系。新菌系的毒性特征明显不同于对应原始菌系。在利用SSR引物RJ24对稳定的4号异核菌系进行分析后，获悉新菌系是通过核的重新组合分配后体细胞杂交(即菌系融合、异核作用)的结果。从分子水平上进一步证实了该新菌系是由两个原始菌系经过异核作用产生的。 2．利用RJ3引物对所选取的15个小麦条锈菌生理小种和三个国外菌系进行了DNA多态性的分析，可以得到白化菌系不同于其它供试小种的170bp左右的特异性扩增片段，经过参试菌系的重复验证，该特异性片段能稳定清晰再现。为后期研究颜色变异或无毒基因提供了参考。 3．利用SSR引物RJ18对17个小麦条锈菌生理小种21个菌系进行DNA多态性分析，在CY26小种上获得了300bp左右特异性扩增片段。进一步对该片段进行了验证，发现该片段仍仅存在于CY26小种上，初步结果表明RJ18引物可以用于CY26的检测。 4．利用SSR引物RJ4引物对17个小种23个菌系进行DNA多态性分析，获得了CY29小种的210bp左右的特异性谱带，经过参试菌系的重复验证发现，该片段能够在CY29上稳定存在，初步表明RJ4引物可以用于CY29的检测。 5．利用引物RJ20对11个小麦条锈菌生理小种进行筛选时获得长度约为310bp的可能与Yr9毒性谱相关的特异带。经过参试菌系的重复验证发现，该片段能够稳定存在，对研究毒性变异提供了一些参考。 本研究获得的有关小麦条锈菌群体毒性变异和小种的信息，可以为未来研究小麦条锈菌的毒性变异和群体进化及监测提供一些参考和帮助。