解脲脲原体的多位点序列分型

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背景及意义解脲脲原体(Ureaplasma, UU)属柔膜纲支原体目支原体科脲原体属,是一种介于细菌与病毒之间的一种能独立生活的最小原核细胞型微生物,它与微小脲原体、生殖脲原体等常常寄居在正常人群生殖道、泌尿道。但也是一种易引起生殖道、泌尿道感染的病原微生物,有大量文献报道,它们会引起男性的前列腺炎、尿道炎,尿结石,肾盂肾炎等,对于女性,还常常是阴道炎、子宫颈炎、盆腔炎、生殖腔道的炎性反应、粘连与阻塞,以及造成不孕不育、流产的病原体之一。曾经我们认为,UU引起的感染是否发生很大程度上取决于人体的抵抗屏障和免疫状态是否正常;但近来有很多文献发现,UU有不同的生物群和亚群,而是否引起感染貌似和他们也有着很大的联系。研究者们已建立了多种针对UU的基因分型方法,包括传统的聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR),限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism, RFLP)等。然而,针对UU特定血清型或亚型与某种特定疾病的关联还未见报道。为了鉴定具有引起特定疾病的UU亚群并研究UU分子流行病学信息,迫切需求新的高分辨率分型方法的建立。本次研究利用基于4个管家基因(ftsH, rpL22, valS, thrS)进行的多位点序列分型(MLST)方法对283株解脲脲原体进行分析,其中包括14种血清型标准菌株及临床样本分离得到的269株解脲脲原体。结果发现MLST序列能够在探索脲原体属分子流行病学及人群构成方面有很高的鉴别能力。目的研究解脲脲原体临床菌株的分子流行病学规律和种群结构,明确遗传背景,为解脲脲原体的感染诊治提供理论参考。方法269株解脲脲原体临床菌株,其中134株来源于有症状患者,135株来源于无症状人群,与14株标准菌株开展多位点序列分型(MLST)研究,并应用MEGA5与START2软件进行生物信息学分析,以揭示其流行趋势。结果分析283株解脲脲原体发现可分成99种序列型(STs),14种血清型标准菌株分为12种STs,269株临床菌株可分为87种特异性STs。ST1和ST22为主要的STs,分别占有68和70株。eBURST分析表明存在两个克隆复合体(CC1和CC2),并且通过标准连锁指数(IAS)分析显示存在连锁不平衡。系统发育学分析显示解脲脲原体14种血清型标准菌株分为两个种群,此结果与解脲脲原体的物种分群(分为解脲脲原体和微小脲原体两类)高度相符。对269株临床菌株进行生物群分析,CC1中的菌株都是微小脲原体,CC2中的是解脲脲原体,此外,阴道炎、输卵管阻塞及子宫颈炎患者中CC2型感染更为多见。结论解脲脲原体MLST方案具有很高的分辨率,适用于解脲脲原体的分子流行病学和种群结构分析。
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