隐孢子虫(Cryptosporidium spp)是一种呈全世界性分布,危害严重的人和动物共患寄生性原虫,可感染人类和其它多种脊椎动物。通过接触人、动物、水和食物,隐孢子虫卵囊会造成威胁人类健康的隐孢子虫病,其主要特征为腹泻。给人类健康带来了巨大的威胁。但尚未研制出治疗隐孢子虫病的特效药,隐孢子虫病的研究就显得极为迫切且必要。黑龙江是我国占地面积和人口数量都名列前茅的省份,北京是我国经济发达城市,人口流动较大,然而这两个地区关于鸟类隐孢子虫病的研究相对较少,所以本研究拟对哈尔滨北方森林动物园和北京动物园开展鸟类隐孢子虫的研究。为我国鸟类隐孢子虫病的防治提供理论依据。本研究以哈尔滨地区北方森林动物园和北京动物园的45种鸟类为研究对象,对隐孢子虫的感染情况及其遗传进化进行分析。本研究采用蔗糖溶液漂浮法对鸟类粪便样品进行虫卵漂浮,并在光学显微镜下观察;通过巢式PCR针对隐孢子虫的18SrRNA基因进行扩增,并进行测序分析。在263份鸟类粪便样本中,来源于白鹤(4份)和火烈鸟(2份)的6份样本为隐孢子虫阳性,阳性率为2.28%(6/263)。其中哈尔滨北方森林动物园的隐孢子虫感染率为0%(0/69);北京动物园的感染率为3.09%(6/194),火烈鸟隐孢子虫的感染率为1.03%(2/194),白鹤隐孢子虫的感染率为2.06%(4/194)。对获得的隐孢子虫序列用DNA star进行分析,经Clustal2.0比对后用Mega6.0构建系统发育树,在进化树上的6个阳性样本获得的6株隐孢子虫(P1、P 2、G3、G4、G5、G6)为微小隐孢子虫(Cryptosporidiumparvum)。本研究首次发现,白鹤和火烈鸟可以感染微小隐孢子虫,为了解鸟类感染的微小隐孢子虫的生物学特性、分子流行病学、虫株之间的遗传进化关系等提供了重要的参考依据,丰富了鸟类感染微小隐孢子虫的数据库。