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目前,转Bt棉花的推广和应用被认为可从根本上减轻其靶标鳞翅目害虫的发生和危害；但相应的也会导致其非靶标害虫(如棉蚜Aphis gossypii Glover和烟粉虱Bemisia tabaci Gennadius)的危害加重等新问题。有研究表明,转Bt棉花外源Bt基因的导入会改变其氮素代谢生理。对转Bt棉花而言,氮素既是核酸、蛋白质等生命物质的重要组成成分,又是生物碱和Bt毒素的主要构成物质；此外,棉蚜和烟粉虱的个体生理和种群发生又与寄主植物组织内的氮素营养密切相关。因此,通过土壤氮肥的优化管理将有