可持续发展是全球的共识，森林可持续经营是林业发展的核心。森林生态系统类自然保护区在我国占主导地位，而且国际上已经认为它是维护陆地最复杂的森林生态系统。本文从系统的角度出发，综合运用系统科学、生态学理论对这类自然保护区进行分析，力求从理论上找出其可持续发展与协同控制的理论依据和手段，为进一步探求这类自然保护区合理、科学的运作模式和管理机制奠定基础。　　 本文探讨了森林生态系统类自然保护区森林生态系统负反馈机制的熵变化状态，认为这类自然保护区实现可持续发展的根本是人类对其森林生态系统的发展利用必须在系统承载力可容忍的范围内。另从这类自然保护区森林生态系统的生物学复杂性演化特性方面分析了这个系统的熵流状态与耗散结构形成机理，认为在人类干扰极少的前提下，这类自然保护区的森林生态系统已形成的顶级群落结构已是耗散结构，而且维持其耗散结构的稳定是对这类自然保护区进行协同控制的根本目的，进而在确定了对森林生态系统进行协同控制的基本条件下，针对这个系统的特性对决定这个系统能否保持耗散结构的序参量进行了选取并构造了森林生态系统协同控制模型，目的在于在维持其耗散结构的前提下理性地预测和开发利用，从而实现可持续发展。