大型科研项目是指涉及科研部门众多、项目周期长、成本费用高而且通常对国家安全以及国计民生有重要影响的科研项目。大型科研项目除具备普通项目共有的特点外,还有很多特有的特点,如投入大、周期长、协作面广、风险大等,尤其是大型科研项目的复杂性问题日益突出,使得其风险管理也具有显著的复杂性,对其实施风险管理的难度增大。虽然国内外学者对风险管理的研究已经不少,但是还没有形成完善的风险管理研究体系,尤其是针对大型科研项目的风险管理方法还很少,研究还局限于费用或者进度的单因素上,对大型科研项目复杂性引起的风险管理问题还没有深入的研究,缺少综合技术、进度和费用等多风险因素的有效的风险管理方法。本文主要分析了大型科研项目风险管理中由于复杂性而引起的问题,构建了模块化风险管理模型,借鉴了风险矩阵的风险模块思想,对项目进行模块化划分,在整个过程中,又都贯穿着集成化思想的指导,这样能使整个项目协调进展,同时,通过对各个模块进行风险评估,确定出各模块的风险等级,使得项目资源得到更加合理分配,这一模型具有使复杂的系统问题得以简单化、使耗时的工期高效化、使集中的决策分散化、包容不确定性、提高创新速度和分散创新风险等特点,最后通过实证分析,证明这一方法适用于大型科研项目的风险管理工作,对降低大型科研项目开发风险,提高项目管理水平,减少管理失误,有效的实现风险控制,提高大型科研项目开发的成功率具有一定的意义。