赤潮是一种特殊海洋生态现象。当某些海洋微藻、原生动物或者细菌大量繁殖或聚集，达到一定的密度而使水体变色，便称之为赤潮。近年中国沿海地区赤潮频发。为了了解并掌握其特点及规律，本研究分析过去几十年中国东海及黄海南部、渤海和南海北部三个高发区赤潮的时空分布、优势种及其变化和季节性特点，讨论赤潮跟环境的相关性。 东海和黄海南部的赤潮发生情况在整个中国近岸海域比较严重，长江口及其以南的两个海域是赤潮高发区。该海域赤潮的频发期由上世纪80年代的7、8月份提前为2000-2004年的5、6月份；这种变化与藻种的变化相关。2000年以前的优势种是夜光藻跟中肋骨条藻，从2000年开始大规模的东海原甲藻赤潮频发。上升流对东海赤潮的发生有很大影响。渤海的赤潮较集中于渤海湾跟大连湾；6月份至8月份是其赤潮高发区；从1992年代开始优势种由中肋骨条藻变为夜光藻，这种变化与渤海海域营养盐的变化有关。南海北部夜光藻是优势种而且全年可以发生赤潮；12月份到5月份是频发季节，季风对赤潮的频发季节有明显的影响。水产养殖加剧了渤海和南海北部的赤潮发生。 研究发现赤潮爆发的频率和影响面积近年都有所增加，已经对中国沿海的环境和经济造成了严重的影响。