近年来，各省市农村专业集贸市场发展迅速，规模不断扩大，带动着周边的工商业经济圈繁荣发展。但是快速发展的农村专业集贸市场的另一面，市场管理落后、成本高、缴纳税款少等问题依然十分严重，引起各级地方政府、职能管理部门的重视并积极寻求解决方案来更好的带动经济的发展。就税务机关而言，基层税务机关工作监管难度较大，征管方式落后、纳税人纳税意识差等问题。　　因此，针对以上问题，基层税务机关对农村专业集贸市场管理大多采用委托代征税款方式进行管理。本文结合作者的基层工作经验和查阅国内外相关文献，选取具有本地经营特色的烟店轴承集贸市场作为调查对象，对烟店轴承集贸市场上的个体工商户税收征管情况作为样本，对烟店轴承集贸市场进行实地考察，对影响纳税人经营、销售的各个因素进行调查研究，从而对烟店轴承集贸市场采取委托代征税款方式进行管理，并找出在具体实施委托代征中存在的具体问题，分析具体存在的问题和问题产生的根源，再从多层次、多角度分析问题的深层次原因。　　最后再把视角放到农村专业集贸市场上，根据具体实例，对解决农村专业集贸市场税收征管问题从体制、人员、宣传、技术、奖惩等方面提出具体的改革建议，内容主要有:一是建立健全制度;二是加强人员管理;三是加强税法宣传;四是进行技术创新;五是奖惩制度到位。