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猪肉品质是猪的重要经济性状,提高猪肉品质是现代种猪选育工作的重要目标之一。然而肉质是一个综合性状且遗传力都偏低,传统育种难以得到好的改良效果,因此对猪肉质性状分子遗传机理的研究就显得十分必要。本实验屠宰并测定了共610头杜长大个体36h肌肉酸度（pH）、剩余糖原含量（RG）、滴水损失（drip loss）、红度（Minolta a*）、黄度（Minolta b*）、亮度（Minolta L*）、肉色（color score）、大理石纹（marbling）、水分（moisture content）等肉质性状表型并利用猪60K芯片进行了全基因组关联分析。结果共检测到17个显著性位点,其中3个SNP达到了基因组显著水平。同时在15号染色体上121 Mb处和134Mb处发现两个同时影响剩余糖原含量、滴水损失和肉色的多效性数量性状位点（QTL）,在此命名为QTL1和QTL2。在QTL1区域（129135 Mb）内,笔者发现一个与RG强关联的SNP SS478944394(129.80 Mb,P=1.18×10-11)和一个与滴水损失及肉色强关联的SNP SS107833468(134.40 Mb,P<10-5),并推测已知的肉质性状主效基因PRKAG3（133.80 Mb）为其候选基因。为确定这一点,本研究在QTL1区域内增加15个SNPs再做关联分析,结果在PRKAG3基因编码区内发现一个更强关联位点—rs42（133.80 Mb）,该SNP与糖原含量(P=1.08×10-49)、滴水损失(P=1.95×10-12)、pH值(P=3.19×10-6)、L*值（P=1.54×10-9）、a*值(P=9.36×10-8)、b*值(P=7.28×10-13)等肉质性状的关联程度都达到了基因组显著性水平,且该位点解释了杜长大群体40.6%的糖原表型变异方差和8.6%的滴水损失表型变异方差。在QTL2区域（120.78122.78 Mb）内,SNP SS478943559（121.78 Mb）与剩余糖原含量(P=4.89×10-10)、滴水损失(P=2.39×10-5)、b*值(P=2.55×10-4)均显著相关,其周边有两个与糖代谢相关的强候选基因FASTKD2及MDH1B。为精细定位QTL2,本研究在其区域内新增了45个SNP标记用于关联分析,结果显示最强关联位点仍为SS478943559,它处在一个23 kb单倍型框（r2>0.8）内。对FASTKD2及MDH1B基因进行cDNA测序发现两个错义突变位点,其中FASTKD2中错义突变SNP g.6742G>A的次等位基因频率为0.4,它与糖原含量、滴水损失关联分析所得P值分别为4.47×10-4、5.37×10-4,因此可以作为种猪肉质选育的一个分子标记。而MDH1B中的SNP g.3597A>G突变与糖原含量、滴水损失相关性不显著（P>0.05）,故排除此SNP作为因果突变的可能性。本研究加深了对杜长大商品猪肉质性状分子遗传机理的认识,同时为开发影响猪肉品质性状的分子标记并为最终鉴别影响糖原含量及滴水损失等相关肉质性状的因果基因或因果突变点奠定了一定的工作基础。