随着家庭和工业对健康植物油及其产品需求的不断增长,可通过分子育种技术从源头上寻找替代品以满足这种需求。近期,CAPS（Cleaved Amplified Polymorphism Sequence）标记已成为分子育种试验重要的分子标记技术。本试验选用两个西瓜品系材料,分别命名为P₁=W1-1（低油份含量）,P₂=PI-186490（高油份含量）,利用F₁和F_2:3代果实测量种子含油率,同时测量其他的种子表型性状（种子长度、种子厚度、种子宽度、种皮厚度、种子百粒重）。PI-186490中种子含油率（SOP）的平均值（平均值为22.25%）显着高于W1-1（平均值为14.75%）。F_2:3代的种子含油率范围为9%至32%。P₁和P₂中其他种子性状的平均值如下:种子长度（8.81 mm、14.71 mm）,种子宽度（5.96mm、10.53mm）,种子厚度（2.06 mm、2.65 mm）,种皮厚度（0.33mm、0.15 mm）,百粒重（4.70 g、18.20 g）。此外,利用145个CAPS标记,结合六种限制性内切酶（Bam HI,Eco RI,HindII,HindIII,HinfI,Pst I）对F₂代群体进行基因分型。构建的连锁图谱覆盖全基因组长度为3000.19 cM,平均距离为20.01 cM。共检测到11个QTL:种子长度（2个QTL）、种子宽度（1个QTL）、种子厚度（1个QTL）、种皮厚度（4个QTL）、种子百粒重（2个QTL）、种子含油率（1个QTL）。LOD值为2.51到36.60,贡献率为3.11%到47.55%。其中,与种子长度相关的QTL 2个,位于6号和10号染色体,总贡献率为51.35%。与种子宽度相关的QTL 1个,位于6号染色体上,贡献率为45.91%。与种皮厚度相关的QTL位于4号染色体上,贡献率为7.88%。与种皮厚度相关的4个QTL分别位于1、3和6号染色体上,共同调控着该性状,总贡献率为58.83%。与种子百粒重相关的QTL位于6号和10号染色体上,总贡献率为39.76%。在6号染色体上检测到唯一一个与种子含油率相关的QTL,其贡献率为14.44%。种子长度、种子宽度、种皮厚度和种子百粒重（qSL-6-1,qSW-6-1,qTSC-6-1,q100SWT-6-1）的QTL均位于6号染色体上小于5cM的相同区域。本研究中还分析了P₁和P₂种子油的理化性质,检测到五种主要脂肪酸（FAs）:棕榈酸（16:0）、硬脂酸（18:0）、油酸（18:1）、亚油酸（18:2）、α-亚麻酸（18:3）。W1-1中主要脂肪酸含量由低到高顺序为:α-亚麻酸（1.09%）、硬脂酸（10.48%）、棕榈酸（20.50%）、亚油酸（26.80%）、油酸（27.04%）;而在PI-186490中为:α-亚麻酸（0.29%）、硬脂酸（10.80%）、棕榈酸（13.36%）、油酸（16.83%）、亚油酸（40.37%）。同时对各种脂肪酸和种子含油率（SOP）做了相关性分析,以探寻两者间可能存在的关系。SOP和多数脂肪酸含量存在显著差异。同时也对其他指标进行检测,包括酸值（mg KOH/g）、游离脂肪酸比例（%）、氧化值（Cox）、皂化值（mg KOH/g）、不皂化物（%）、相对密度（25℃）。与食用油和工业油标准相比,西瓜种子油具有稳定性、可食用性,同样也具有一定的工业和经济潜力。本研究提供的种子含油率和检测到的QTL位点将为未来西瓜高油份品种选育提供有利数据支持。