BRCA1两种主要单倍型与中国汉族女性散发性乳腺癌风险相关性研究

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乳腺癌是女性最常见恶性肿瘤,其发生发展涉及多重遗传学因素、环境因素及其复杂的交互作用,而在相同环境曝露下,遗传背景差异将导致个体乳腺癌易感性的差别。遗传背景差异主要由基因遗传多态性构成;近年来的研究已表明,基因多态性作为重要的表观遗传学内容参与了不同疾病风险,其中单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)系主要组成部分。BRCA1是迄今为止所发现最重要的乳腺癌易感基因,其突变与家族遗传性和早发性乳腺癌的高度相关性已被证实,但在散发性乳腺癌患者中甚少检出BRCA1致病性突变。因此,BRCA1基因中广泛存在的SNPs及其紧密连锁构成的单倍型与散发性乳腺癌风险之间的关联受到广泛的研究关注。目的探讨BRCA1数个SNPs形成单倍型情况及其与中国汉族女性散发性乳腺癌的风险相关性。方法首先通过生物信息学分析考察中国汉族人BRCA1SNP多态性及其连锁单倍型构成,随后以其中2731C>T为适用标签位点,采用PCR-PIRA(PCR-primer introduced restriction analysis)分析进行对照-乳腺癌大样本内个体SNP等位基因分型及单倍型归类计数,分析其组间频率差异。结果1) BRCA1基因11号、13号和16号外显子内2201CT>、2430T>C、2731C>T、3232A>G、3667A>G、4427C>T和4956A>G等七个SNP位点等位基因型呈紧密连锁,构成汉族人BRCA1两种最主要单倍型,即CTCAACA表征的野生型和TCTGGTG表征的突变型;2) PCR-PIRA分析成功进行了个体ARCA12731C>T等位基因分型、进而个体单倍型的判别。3)1182例乳腺癌患者中BRCA12731位野生型纯合子(CC)、突变型纯合子(TT)和杂合子(CT)三种基因型个体分别为427例(36.1%)、171例(14.5%)及584例(49.4%);1171例对照组中则分别为482例(41.2%)、158例(13.5%)及531例(45.3%);即两组间野生单倍型与突变单倍型频率分别为60.8%vs.63.8%和39.2%vs.36.2%,差异具有显著性(P=0.03),提示BRCA1突变单倍型增大汉族女性携带者的乳腺癌发生风险(OR=1.065[95%CI,1.006~1.124])。
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