青檀(Pteroceltis tatarinowii Maxim.)为我国特产的榆科单种属植物,起源于新生代第三纪,连续分布于温带到亚热带的石灰岩地区,为国家三级濒危保护植物,在分类和特有濒危植物研究中具有重要意义。本研究运用含荧光标记的AFLP和SRAP分子标记分析了国内11个青檀天然居群的遗传多样性和种群分化情况,为青檀的种质资源评价、收集和保护提供了有力的分子生物学依据。实验结果如下:遗传多样性:AFLP标记一共获得大小为50~500bp的谱带159条,其中多态性谱带142条。8对SRAP引物共扩增出谱带125条,其中113条为多态性谱带。在物种水平上,期望杂合度(He)为0.2239(AFLP标记)和0.2544(SRAP标记),Shannon信息指数(I)是0.3350(AFLP标记)和0.3941(SRAP标记),多态位点百分率(PPL)是89.31%(AFLP标记)和90.40%(SRAP标记)。这两种分子标记都能很好地应用于青檀的遗传多样性评估,且得到的结果比较一致,皆表明在物种水平上青檀具有较高的遗传多样性。居群的遗传分化和遗传结构:居群的遗传分化系数为0.2073(AFLP标记)和0.2607(SRAP标记),表明有20.73%(AFLP标记)和26.07%(SRAP标记)的遗传变异主要存在于居群间。通过基于AFLP数据的NJ树分析和基于SRAP数据的UPGMA聚类分析进一步说明了居群间的亲缘关系。在NJ树聚类和UPGMA聚类分析中,采自北京和河南的3个居群被聚到了一起,采自山东、安徽和湖北的3个居群被聚到了一起,两种聚类分析仅仅在采自江苏、江西、湖南、贵州、广西的5个居群的聚类上出现了分歧。此外,Mantel检验表明各居群之间的遗传距离和地理距离之间并没有显著的相关性(AFLP:r=0.28483,p>0.05;SRAP:r=0.32670,p>0.05)。在AFLP数据的STRUCTURE分析中,ΔK峰值出现在K=2,说明K=2为最适K值,11个青檀居群的遗传结构可以大致分为2组。在K=2时,中国11个青檀居群分为两个主要群体A和B,A组中包含了采自北京、河南、山东、安徽、湖北的6个居群,B组包括采自江苏、江西、湖南、贵州、广西的5个居群,此结果与UPGMA聚类分析结果相一致。青檀个体之间的关系通过PCoA分析发现,只有13.99%的总方差能通过前3个要素展示出来。PCoA分析的三维影像中,尽管有部分个体混杂在一起,还是能够将这些个体分为4个组,该聚类结果也和UPGMA的聚类结果相似。保护策略:本研究结果表明,青檀在物种水平上有着很高的遗传多样性和中等程度的居群遗传分化水平。对于中等程度遗传分化的青檀来说,应当考虑该物种特殊的生境,首先还是建议就地保护;其次,采自贵州的青檀居群和其他居群的遗传距离相对较远,应该引起足够的重视,建议对其进行迁地保护,这将确保青檀大多数的遗传变异得以续存;最后,小的植物居群更容易因为随机的遗传漂变导致的遗传变异的损失、自交的增加以及亲缘关系很近的个体之间的交配而灭绝,如分布于贵州和湖南的两个居群规模比较小,检测也发现这两个居群的遗传多样性相对于其他居群来说较低,应当考虑就地或迁地保护。