宁夏酿酒葡萄卷叶伴随病毒多重RT-PCR检测及变异群体的SSCP分析

来源 :宁夏大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wyc319
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
葡萄卷叶伴随病毒(Grapevine Leafroll associated virus,简称GLRaVs)是世界范围内分布最广,造成损失最严重的一种葡萄病毒病,已成为世界葡萄栽培地区中的一个严重问题。宁夏贺兰山东麓地区是国内重要的酿酒葡萄栽培基地之一,有关GLRaVs在宁夏酿酒葡萄植株中的感染情况、GLRaVs的分子检测、株系变异及其与分子特性关系的研究报道较少。本研究在对宁夏酿酒葡萄病毒病田间自然发病情况调查的基础上,建立了 GLRaVs多重RT-PCR检测体系,并对GLRaVs宁夏分离物的分子变异及群体结构进行PCR-SSCP分析,从而为宁夏GLRaVs群体结构变化监控及病害控制奠定基础。研究结果如下:1、对宁夏贺兰山东麓8个种植地区8个酿酒葡萄品种的病毒病田间自然发病情况进行调查,采用RT-PCR方法,检测了共40份样品中GLRaV-1~5这5种葡萄卷叶伴随病毒的感染率。结果表明:宁夏贺兰山东麓酿酒葡萄主要病毒病有葡萄卷叶病、扇叶病和栓皮病,其中葡萄卷叶病尤为严重;不同种植区和品种间葡萄卷叶病的感染存在着差异,老葡萄种植区中品种间葡萄卷叶病发病率明显高于新葡萄种植区的品种;“蛇龙珠”和“黑比诺”是感染葡萄卷叶病毒的主要品种,发病率高达85.1%和52.7%;利用5种葡萄卷叶伴随病毒特异性引物进行RT-PCR检测,仅检出3种病毒类型,且GLRaV-3的检出率最高,为87.5%。2、对宁夏贺兰山东麓酿酒葡萄卷叶病进行RT-PCR检测,在单一RT-PCR检测的基础上,对2种卷叶伴随病毒的多重RT-PCR模板浓度、引物浓度、退火温度和TaqDNA聚合酶浓度进行了优化,建立了同时检测GLRaV-1和GLRaV-3的多重RT-PCR技术体系。模板浓度、引物浓度和TaqDNA聚合酶量对多重RT-PCR的扩增有很大的影响,而退火温度对检测结果的影响相对较小。对2种葡萄卷叶伴随病毒的PCR产物进行克隆和测序,扩增基因片段与GenBank中登录的基因序列同源性为96%-99%。所建立的多重RT-PCR技术检测田间样品效果良好。3、采用SSCP技术对所检测到的8个GLRaV-1宁夏分离物和13个GLRaV-3宁夏分离物进行遗传变异分析。经SSCP分析可知,8个GLRaV-1宁夏分离物之间有明显差异,可归为3类;13个GLRaV-3宁夏分离物之间也有明显差异,GLRaV-3-CP和GLRaV-3-HSP70分离物均归为2类,而GLRaV-3-RdRp分离物归为3类。分离物在不同种植区间和不同品种间均表现差异性。4、对获得的阳性样品进行GLRaVs的CP、HSP70和RdRp基因组的克隆和测序分析。结果表明,GLRaV-1宁夏分离物GLRaV-1-NX1和GLRaV-1-NX2的CP基因序列为232bp,其两种分离物间的核苷酸序列同源率为90%,与已报道的国内外其它分离物CP基因序列相比,核苷酸序列同源率为 90%-99%;GLRaV-3 宁夏分离物 GLRaV-3-CP-NX1 和 GLRaV-3-CP-NX2 的 CP 基因序列为942bp,其两种分离物间的核苷酸序列同源率为40%,与已报道的国内外其它分离物CP基因序列相比,核苷酸序列同源率为40%-99%;GLRaV-3宁夏分离物GLRaV-3-NX的RdRp基因序列为683bp,其各分离物间的核苷酸序列同源率为90%以上,与已报道的国内外其它分离物RdRp基因序列相比,核苷酸序列同源率为90%-99%;GLRaV-3宁夏分离物GLRaV-3-NX的HSP70基因序列为546bp,其两种分离物间的核苷酸序列同源率为96%,与已报道的国内外其它分离物HSP70基因序列相比,核苷酸序列同源率为96%-99%。
其他文献
改革开放以来,我国的国际地位不断提升,逐渐成为物流大国,并将进一步转型成为物流强国.近几年,我国颁布了许多关于在交通领域深化改革的政策,其中,“一带一路”倡议是我国发
期刊
研究了随机形式幂级数的Padé逼近.证明了任意Padé逼近的a.s.存在性.
当我们的投资机构和投资者仍然为股权分置彷徨、迷茫之际,欧洲的基金经理们则在静俏悄地梳理着他们的兴奋点了。真是羡慕他们,他们已经摆脱了那些“琐事”的羁绊,只一心一意
目的:探究精神分裂症患者采用认知心理治疗对疾病复发的预防作用.方法:纳入2016年1月—2017年11月本院接收的精神分裂症患者76例,遵从随机化分组原则均分为参照组、干预组,前
看了今年《新闻战线》第5期毛志远同志写的《“告记者”两面观》一文,本人感慨颇深。故也想就个人体会谈谈对“告记者”的一点浅见。自党的十一届三中全会以来,我先后在所在
目的:对比分析人工流产术后即刻放置曼月乐及宫喜环的避孕效果.方法:选取2017年2月至2018年11月我院妇科门诊收治的48例人工流产术妇女,随机分成两组,研究组与对照组各24例.
癫痫是一组反复发作的神经元异常放电所致的暂时性中枢神经系统功能失常的慢性疾病.临床上由多种脑部道不病损和代谢障碍引发症状性癫痫.本例报告1例糖尿病酸症酸中毒导致Jac
选育和推广良种是提高茶叶产量,改进茶叶品质的一项经济有效的技术措施。中国农业科学院茶叶研究所于1953年从浙江省平阳县桥墩茶场引进平阳云大茶籽进行播种,并对其实生后
目的:观察心理治疗和改善睡眠降低血压变异性的临床效果.方法:两组患者均给予氨氯地平治疗,对照组单独给予患者药物治疗,观察组在给药的基础上,通过心理治疗及改善睡眠的方式
目的:探讨髌骨骨折术后功能障碍的物理疗法联合运动康复治疗效果.方法:选取2016年6月至2017年6月收治的髌骨骨折患者60例,采取随机分组,即观察组和对照组各30例,对照组给予物