随着我国经济体制、科技体制改革以及国防科技工业市场化改革的不断深入,军工科研单位面临着日益激烈的竞争环境。外部环境的变化动摇了军工科研单位传统的科研生产管理理念,迫使它们开始采取各种措施来加强成本控制,获取行业竞争优势。对军工科研单位成本控制进行研究必须立足于其特有的科研生产流程。本文对军工科研单位的业务特点、成本构成以及成本控制现状进行了详细的分析,指出了加强军工科研单位成本控制的必要性。在此基础上,本文将现代成本控制理论引入到军工科研单位成本控制框架的构建中,为军工科研单位构建了两层次成本控制框架。最后,本文将两层次成本控制框架应用于隶属于军工行业的X研究所,介绍了两层次成本控制框架的具体应用。本文将战略成本控制的思想引入到军工科研单位成本控制框架的设计中,并针对军工科研单位科研生产活动特点提出了在项目实施过程推行按阶段滚动的动态项目成本预算模式以及加强对业务流程源头设计阶段以及关键成本要素进行控制的理念和方法。相比较前人的研究,本文所做的工作更系统、更具有实务上的操作性。