野生动物非法贸易是全球最严重的暴利犯罪活动之一,不但严重破坏生物多样性及生态环境,同时走私运输也是新发和再发传染病重要的传播途径,严重威胁人类社会的公共卫生安全。虽然存在极大的生物安全风险,但是这类非法走私的野生动物所携带病原体的相关研究却极其有限。穿山甲是全球被走私数量最多的哺乳动物,是全球野生动物非法贸易的代表性物种。由于一些传统的“食补”观念及中医药材的需求,我国是大部分穿山甲走私的目的地。伴随着穿山甲的非法走私运输,其携带的病原体也会随之输入我国。在2018年7月-8月期间,浙江省金华市野生动物保护站救助了四只穿山甲(3只马来穿山甲,1只中华穿山甲)。这四只穿山甲在被救助后不久均出现了拒食等表现不一的临床症状。在野生动物保护站工作人员的悉心照顾和对症治疗下,其中1只中华穿山甲病情逐渐好转。然而剩余的3只马来穿山甲治疗效果不佳,并在救助后的半个月时间相继死去。为了查找引起这四只穿山甲疾病的病原体,我们对这四只穿山甲的样本进行了核酸(RNA)提取和转录组文库构建。通过宏转录组测序、生物信息分析并结合反转录PCR(RT-PCR)的方法,在两只死亡的马来穿山甲(分布编号为1-Dongyang和2-Lishui)体内分别检测到了瘟病毒和Colti病毒。基因组分析表明,这两种RNA病毒与已知的瘟病毒和Colti病毒在氨基酸水平上分别有超过48%和25%的序列差异,结合这两种病毒在进化树中所处的位置,我们认为它们分别是瘟病毒属(Pestivirus)和Colti病毒属(Coltivirus)的一个新的病毒种。根据采样地点和宿主,我们将新型瘟病毒和新型Colti病毒分别命名为东阳穿山甲病毒(Dongyang pangolin virus,DYPV)和丽水穿山甲病毒(Lishui pangolin virus,LSPV)。此外,我们在寄生于1-Dongyang穿山甲体表的爪哇花蜱幼虫样本中也检测到了DYPV。由于在1-Dongyang穿山甲体表的蜱中检测到DYPV,而Colti病毒是众所周知的节肢动物传播的病毒,此外LSPV与澳大利亚蜱中检测到的Shelly headland病毒同源性最高,因此我们在穿山甲被救助的地点附近采集了蜱的样本共计452份,以期探讨这两种病毒的来源与传播途径。通过RT-PCR和宏转录组学的方法,我们在这些样本中并未检测到与这两种新病毒同源的序列,提示这两种病毒可能都不是来源于浙江本地。此外,穿山甲线粒体细胞色素b基因(mt-cyt b)的进化分析显示携带这两种新病毒的马来穿山甲可能都来自东南亚。这些流行病学调查的结果显示这两种新病毒可能是由于穿山甲的非法国际贸易而输入到我国的。综上,我们的研究表明非法野生动物的贩运不仅威胁穿山甲种群的生存状态,还可能传播传染性病原体。虽然目前并未有这两种病毒感染人类或者家畜的报道,但是由于其存在潜在的生物安全风险,还需持续进行监测。