Graves病易感位点的筛查和功能初探

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Graves病是一种常见的多基因疾病,在中国它的发病率约0.25-1.09%,是最常见的自身免疫疾病之一。Graves病的发生是由基因和环境因素的共同影响所造成的,可能有多个基因参与了对疾病的贡献,并且环境因素在其中也起了很大的作用,因此发病机理比较复杂。通过连锁分析,人们发现了许多与Graves病可能相关的染色体易感区段,其中位于5q31区段的结果同时得到了中国和日本研究小组的确认,因此在这一区域很可能包含一个至少在东亚人群中比较特异的易感位点。 在5q31区域Lod值最高的Marker D5S2090附近的3.0MBK区域,我们按照每100Kb选择一个SNP的方法,寻找易感位点。在总共选择的29个SNP中,有两个有统计学差异,其中rsl368408处的P值达到8.74 X 10<-9>。接下来我们将关注的目光进一步缩小到rsl368408附近的1.OMB区域。我们将这一区段包含的全部11个基因的外显子和启动子区进行全测序,共发现了52个SNP位点;同时对于基因间的区域,按照每5KB一个SNP位点的原则从NCB工的dbSNP数据库共选择了39个SNP位点。将这1.0MB区域内选择的全部91个SNP,采用MassArray Sequenom技术,对从山东和上海地区采集的两组人群进行测序。通过病例对照分析,发现在山东人群中一共有22个SNP位点有统计学差异,并且差异位点最多且统计学意义最明显的位点都位于UGRPl基因上,其中位于启动子区的P2位点有最显著的P值(P=1.37×10<-8>)。上海人群中虽然有统计学差异的位点数目少于山东人群,但整体趋势很相似,且统计学差异最显著的位点也是位于UGRPl的P2位点。接下来,我们对两组人群UGRPl基因的9个SNP位点组成的单倍型进行了分析,结果显示包含启动子区P1+P2或P1+P3两个SNP组成的单倍型统计学差异最明显。 通过构建包含P1+P2、P1+P3单倍型以及启动子区不含SNP位点变化的正常序列的报告基因质粒,我们通过荧光素酶试验发现:相对于正常的启动子序列,启动子区含有单倍型改变的UGRP基因转录水平明显下降。此外我们还收集了93例正常人的甲状腺组织,通过Real-timePCR证实了在体内也有同样的情况存在。Northern blot和RT-PCR试验显示UGRPl基因的受体在很多免疫相关的组织都有表达,这进一步提示我们UGRPl可能与Gralves病这种自身免疫疾病有很强的相关性。最后,我们还对启动子区含有单倍型改变以及不含SNP改变的Graves病人组织标本做了基因芯片分析,希望对我们进一步研究两者的关系有提示作用。
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