上世纪90年代以来,随着招生比例的不断提高,高校的规模得以迅速扩张,而高校教育体制改革的不断深入使高校办学自主权逐渐扩大,高校的功能呈现出多样化的特点,很多高校在从事教学科研工作的同时,还积极开展第三产业如对外投资、创办企业或是校企合作办学等活动、建立新校区、创办二级学院等,高校经费渠道已由仅仅依靠国家单一财政拨款向多元化筹资渠道的格局转变,经费的支出也呈现出复杂化的趋势,资金的使用涉及到教学科研、基本建设、专项支出及后勤保障等多方面。这些多元化的收入来源虽然能为高校的快速发展提供强大的资金支持,但是同时也使得高校的财务风险不断增加,近几年不断有学校被爆出负债过多难以承受,甚至偶有贪污舞弊的事件发生,在给高校资产造成巨大损失的同时也降低了高校的办学效益并损害了高校的声誉,而高校财务内部控制制度不健全,落实不到位是造成这种现象的重要原因之一。因此要想使高校资金合理筹集及使用,使高校的财务控制走向规范化和科学化,从而推进高校持续健康的发展,就必须要建立一套科学完善的财务内部控制制度并认真加以执行。本文以四川西部的S大学为例,以COSO报告和中国《企业内部控制基本规范》为理论基础,在已有研究文献的基础上,结合S大学的实际情况,分析S大学在财务内部控制方面的问题及其原因,针对学校内部存在的日益严峻的财务风险,如高额银行贷款的风险防范和控制等,并以此案例为例,有针对性地提出一些健全和完善学校财务内控制度的可行的对策建议,使学校能够加强财务内部控制管理水平,以更好地保障学校的教学、科研及管理。