基于数据库的结肠癌不良预后核心基因筛选到CCNA2基因及其作用机制

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目的:结肠癌是全球第3大常见癌症,也是癌症相关死亡的第3大主要原因。发病率不断攀升。2020年,全球就有超过190万结直肠癌新增病例和93万结直肠癌死亡病例。而在中国,有超过55万人新患结直肠癌,占中国新确诊癌症人数的12.2%,即不到8位患者中有1位是结直肠癌。本文利用多数据库进行挖掘,探寻结肠癌不良预后的核心基因,寻找结肠癌临床治疗的潜在靶点,以期通过新的治疗手段提高结肠癌患者总生存期。方法:选择TCGA和GEO数据库中结肠癌m RNA数据:TCGA-COAD、GSE39582和GSE44607,鉴别差异表达基因。并利用DAVID数据库进行GO分析和KEGG分析。采用String数据库构建PPI网络,从子网络中获取自由度排名前5位的基因,并验证其与预后的关系。随后验证其甲基化修饰情况、蛋白质表达水平和免疫浸润情况。结果:TCGA中差异表达基因4676个;GSE39582中鉴别出差异表达基因2466个;GSE44076中鉴别出差异表达基因2567个,三者共有的差异基因1117个。KEGG分析发现,差异表达基因主要参与代谢途径、PI3K-Akt信号途径以及细胞周期等信号通路传导。K-M生存分析后发现上调表达基因CCNA2与结肠癌不良预后相关(p<0.05)。CCNA2在结肠癌中高表达(p<0.05)。免疫组化显示结肠癌组织中CCNA2蛋白过表达。免疫浸润分析显示,在结肠癌中CCNA2与B细胞、CD8+T细胞、中性粒细胞以及树突细胞呈正相关(p<0.05);与CD4+T细胞和巨噬细胞无显著相关性(p>0.05)。结论:结肠癌组织中CCNA2基因表达水平较高,与免疫浸润细胞相关性较高。CCNA2基因高表达患者的预后较差。
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