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为探讨SLA及转铁蛋白多态性与仔猪大肠杆菌K88腹泻的关系，本研究利用PCR产物直接测序技术、PCR-SSCP技术和不连续聚丙烯酰胺凝胶蛋白电泳技术，以两个中国地方猪种久仰香猪、剑白香猪和一个外国猪种长白猪同胞半同胞0-28日龄仔猪混合家系试验猪群为试验材料，研究了SLA-DQB外显子2、SLA-DRB外显子2、SLA-DQB近端调控区、SLA-DRB近端调控区以及转铁蛋白的多态性，分析了这些多态位点对0-28日龄仔猪大肠杆菌K88ab、K88ac和K88ad小肠粘附型以及血清IgG含量的影响，以寻找有用的遗传标记应用于猪的抗病育种实践。研究结果表明： (1) SLA-DQB外显子2和SLA-DRB外显子2中存在丰富的多态位点。SLA-DQB外显子2中存在38个多态位点，占所扩增序列总长度的13.9％；而SLA-DRB外显子2中的多态位点高达62个，占扩增序列总长度的25.3％。 (2) SLA-DQB外显子2中位点111、113、114、142、184对0-28日龄仔猪血清IgG含量有显著影响(p＜0.05)；SLA-DRB外显子2中位点29、149、170对0-28日龄仔猪血清IgG含量有显著影响(P＜0.05)，某些位点不同的基因型之间血清IgG含量差异显著(p＜0.05)，但血清IgG含量最小二乘均值最高的基因型并不特异的分布在某个或某些品种(系)中；这8个位点的基因频率在所研究三个猪种(系)中差异显著。 (3) SLA-DQB外显子2中的多态位点与仔猪大肠杆菌K88ab、K88ac、K88ad粘附表型之间没有关联(p＞0.01)。SLA-DRB外显子2中位点29与仔猪大肠杆菌K88ad粘附表型存在显著的关联(p＜0.01)。 (4) 首次得到了SLA-DRB基因5′上游近端调控区(URR)序列(GenBank序列号AY365420)和SLA-DQB基因的5′上游近端调控区(URR)序列(GenBank序列号AY456637)。分析表明其含有MHCⅡ类基因调控区共有的高度保守的调控元件X box，W box，Y box及CCAAT，TATA box等，而且这些调控元件遵循严格的空间顺序：总共得到了12个SLA-DRB和14个SLA-DQB近端调控区新等位基因序列，这26条序列中都存在MHCⅡ类基因共有的调控元件如X box，W box，Y box及CCAAT，TATA box等且遵循严格的空间顺序。 (5) 在SLA-DQB近端调控区发现了9个多态位点；在SLA-DRB近端调控区发现了24个多态位点。SLA-DRB近端调控区的多态性比SLA-DQB近端调控区高的多；调控元件中Y box在DRB基因近端调控区中是多态的，DQB和DRB基因近端调控区中的其他调控元件却全部是保守的。 (6) SLA-DRB近端调控区位点-12和-28对0-28日龄仔猪血清IgG含量有显著的影响(p＜0.05)，而SLA-DQB近端调控区中9个多态位点对0-28日龄仔猪血清中IgG含量影响不显著(p＞0.05)；SLA-DRB近端调控区的多态位点与仔猪大肠杆菌K88ab、K88ac、K88ad粘附表型没有显著的关联(p＞0.01)；SLA-DQB近端调控区的位点-20与仔猪大肠杆菌K88ab粘附表型存在显著的关联(P＜0.01)。 (7) 转铁蛋白基因和仔猪大肠杆菌K88ab和K88ac的不同粘附表型确实存在显著的关联(p＜0.01)。而转铁蛋白与仔猪大肠杆菌K88ad粘附表型的关联没有达到1％的显著性水平。