禽流感H5亚型HA基因的克隆及序列分析

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正文:禽流感是造成养禽业巨大损失的烈性传染病。研究表明其HA基因是诱导机体产生抗体的主要免疫原,是机体对禽流感病毒产生体液免疫的主要靶抗原,在机体的抗感染免疫中起重要作用。本研究对HA基因进行克隆,为以后核酸疫苗的研制奠定基础。将禽流感病毒(H5N1)接种12日龄SPF鸡胚,所得尿囊液浓缩后,一步法提取病毒RNA。以其基因组为模板,根据禽流感H5亚型参考毒株HA基因序列,设计合成了一对特异性引物PAI1和PAI2,经反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增出本毒株的cDNA,所得片段连接到载体pMD18-T后,转化大肠杆菌。转化子经BamH□,Hind□酶切鉴定、PCR鉴定后,获得阳性重组质粒pHABZ。通过双脱氧末端终止法对重组质粒进行测序。结果表明所克隆片段大小约为900个碱基。经NCBI blastn在线软件分析表明:其与国内外已发表的各代表株HN/2002、HK/2000、SH/2000、HK/97、Michigan/80的核苷酸序列同源性为80.0%~98.6%,与A/chicken/Hong Kong/481/97(H5N1)毒株的同源性也高达97.8%,且只有部分核苷酸发生变异。推导的氨基酸序列的同源性为89.7%~98.3%。同时分析表明该核苷酸含有强毒株裂解位点的特征性序列,从而从分子水平证明了该病毒分离株为高致病力毒株。所克隆的基因为建立快速准确的分子生物学诊断方法提供了可靠的依据,同时为基因工程疫苗的研制奠定基础。
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