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水稻是世界上最重要的粮食作物之一,对高产品种产量性状的解析在保证粮食安全上有重要意义。水稻产量三要素为有效穗数、每穗粒数和千粒重。内2优6号是一个高产优质的三系超级籼稻品种,本研究利用其亲本内2B(Nei2B)和中恢8006(R8006)创新性地构建了重组自交姊妹系群体,随后利用全基因组重测序技术构建高密度遗传图谱并对产量性状QTL进行定位以及验证,所得主要结果如下:1、构建来源于杂交稻亲本内2B/R8006的重组自交姊妹系,自F7代一个家系从中挑选2个单株继续自交至F15代完全无分离为止。在F15从重组自交姊妹系中选取386个单株进行全基因组重测序。一共获得了1.05T的数据。双亲内2B和R8006平均测序深度分别为60.48-fold和79.38-fold。386个重组自交姊妹系的平均测序深度是8.10-fold,一共比对到4983203个SNP和1232964个InDel位点。过滤偏分离及覆盖度低于75%的标记,一共得到了3203个有效Bin标记,包含902969个SNP标记。最终得到遗传图谱的总图距为1951.13 cM,相邻Bin标记间的平均遗传距离为0.61cM。遗传距离和物理距离的比值从2.8到6.1 cM/Mb,平均值是5.0 cM/Mb。聚类分析发现所有386个家系都能成功聚类,说明姊妹系构建成功。2、在富阳和陵水两年两点四个环境下,一共检测到43个和千粒重(TGW)、每穗粒数(GNP)、有效穗数(NP)和单株产量(GYP)相关的QTL,包括4个NP,13个GNP,18个TGW和8个GYP相关的QTL。有9个QTL在多个环境下可以检测到,分别是:qTGW-1a、qTGW-3、qGYP-6b、qGNP-6c、qTGW-7、qNP-7、qTGW-10b、qTGW-10c和qTGW-12。经与前人发表结果比较发现有4个QTL是新位点:qGNP-6c、qTGW-7、qNP-7和qTGW-12。3、随后本研究利用成对姊妹系在2018年夏天对6个QTL进行了验证。姊妹系Q277-Q278和Q239-Q240在qNP-7位点的亲本来源不同,不但在有效穗性状上差异达到显著水平,并且单株产量也有显著差异。姊妹系Q124和Q125差异区间包含qTGW-1a,姊妹系Q378和Q379差异区间包含qTGW-7,姊妹系Q317和Q318基因组差异区间包含qTGW-10b和qTGW-10c,这些姊妹系在千粒重上有显著差异。成对姊妹系Q70-Q71、Q146-Q147和Q380-Q381在qTGW-12区间上基因型不同,这三对姊妹系在千粒重上都有显著差异。4、最后,本研究对控制千粒重的QTL qTGW-12进行了进一步的遗传定位研究。768个F10代在19年海南种成家系,用连锁标记挑选剩余杂合体种植F3群体用于定位。19FY-12的籽粒的长宽比性状符合预期比值。从中挑选极端表型进行集群分离分析法分析,结果显示在第12染色体16.12Mb-26.47Mb的区段与籽粒长宽比相关,一共获得17个候选基因,其中出现蛋白质序列改变的基因是OsR498G1222170400、OsR498G1222171900和OsR498G1222173400,本结果进一步验证了qTGW-12的遗传存在,为未来的图位克隆改QTL打下了基础。