我国是一个农业大国,农业关系国计民生,但近年来,农业的发展遇到了阻碍,农产品的流通不畅是其中一个重要原因,因此农产品供应链的研究日益增多,逐渐成为学术界的热点。本文主要研究农产品供应链的利润分配问题。成员参与农产品供应链是为了获得竞争优势、使利润最大化。作为参与成员,不仅要实现整个农产品供应链利润的最大化,而且要实现它参与农产品供应链合作所能获得的利润多于它单干时所能获得的利润。因此,在农产品供应链中,如何把整个农产品供应链的利润公平、公正、合理地分配给各参与企业是至关重要的。出于以上目的,考虑农产品的损耗率,分别构建了农产品生产商主导的二级和三级农产品供应链,分析农产品供应链参与成员合作的必要性,得出各参与成员必须合作才能使农产品供应链利润最大化；然后在模型中引入利润分配因子θ,利用Stackelberg博弈模型,求出农产品供应链中各成员及整个农产品供应链的利润,探讨了利润分配因子θ的变化对各成员利润及整个农产品供应链利润的影响,结果得出在各参与成员合作的情况下,农产品供应链的总利润实现了最大化,核心企业的利润要优于不合作时候的利润,且核心企业和整个农产品供应链的利润都随着利润分配因子的不断增长而增长。而非核心企业的利润是先递增后递减,甚至会减少到比不合作时的利润要少。接着运用Shapley值法对利润进行分配。最后通过算例验证农产品供应链的利润分配模型的有效性。