稻瘟病是水稻生产上最具毁灭性的病害之一,严重影响水稻产量。选育和种植抗病品种是防治稻瘟病最为经济有效和环境友好的措施。由于稻瘟菌遗传结构复杂，种群演替迅速，导致能克服寄主抗病性的小种快速形成优势，最终使得水稻抗病性“丧失”。因此，分析稻瘟病菌群体生理小种组成，把握稻瘟病菌的群体遗传结构与变化规律，为生产实践中抗病品种的布局、病害预测和预报提供重要依据，可以有效防止抗病品种抗性“丧失"而造成的病害大流行。武陵山区具有特殊的生态条件，是我国稻瘟病病害的重发区域。本研究以武陵山区的鄂西南为代表地区，搜集稻瘟病菌株，进一步构建该地区的稻瘟病菌生理小种文库，分析其生理小种类型，研究其遗传结构差异，以期为该地区病原菌的变化趋势和抗病品种的选育提供理论基础。取得的主要结果如下：1.通过单孢分离纯化，从鄂西南7个水稻主产区采集的病样稻秆上共分离到82株菌株。选取6种不同的产孢培养基，比较菌株的产孢情况，发现加入梅汁可以有效地增强稻瘟病菌的产孢能力。对初步分离得到的82株菌株，根据是否可产生典型的稻瘟病单孢（梨形的有隔单孢）来进行病原菌单孢的鉴定。52株菌株可产生典型的稻瘟病单孢（梨形的有隔单孢），确定为稻瘟病菌株；30株菌株无法产生典型的稻瘟病单孢，确定为非稻瘟病菌株，在随后的研究中从材料中剔除。2.对纯化鉴定得到的52株菌株进行菌落形态的鉴定分析,根据稻瘟病菌培养5天和10天后菌落的形态色泽差异，简单的分为3类。对其中的34株代表菌株进行了RAPD和REMAP标记的分子指纹分析，初步构建分离菌株谱系，根据其遗传差异可以将34株菌株分为6个谱系。3.登记品种来源、形态分类和分子指纹等信息，保存菌株至-80℃，初步构建了包含52株菌株的鄂西南地区的稻瘟病菌生理小种文库。