磁珠富集法提高痰涂片结核菌检出率和吡嗪酰胺耐药相关基因pncA和rpsA的突变研究

来源 :北京市结核病胸部肿瘤研究所 | 被引量 : 2次 | 上传用户:owen1986
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背景:研究表明,相比于直接痰涂片显微镜检测结核菌,对痰液进行前处理可以提高阳性检出率,比较常用的方法是离心沉淀法。然而,由于操作较为复杂,而且又需要离心机,目前仅有少数实验室能够实现在镜检前对痰液进行离心浓缩。本实验研究的目的在于评估通过磁珠富集浓缩的方法,提高结核病实验室的痰涂片的阳性检出率方法:以2011年6月至2011年10月期间,北京胸科医院临床肺结核患者痰标本129例为研究对象。对每一份痰标本应用磁珠(TB-BEADS,英国Microsens生物技术公司)进行分枝杆菌富集后分别进行痰涂片的萋-尼染色/光学显微镜检查和荧光染色/二极管发光荧光显微镜检查(LED荧光显微镜),并平行以直接痰涂片的/光学显微镜检查、荧光染色/LED显微镜检查,罗氏培养和快速培养作为对照。采用x2检验对上述方法进行统计学分析。结果:①以固体罗氏培养为标准,直接痰涂片萋-尼染色法和荧光染色法的敏感度分别为45%(29/64)和52%(33/64),特异度95%(62/64)和95%(62/64);经磁珠富集细菌后痰涂片萋-尼染色法和荧光染色法的敏感度分别为67%(43/64)和73%(47/64),特异度分别为85%(55/64)和83%(54/64)。②以液体MGT960培养为标准,直接痰涂片萋-尼染色法和荧光染色法的敏感度分别为43%(32/74)和49%(36/74),特异度分别为100%(55/55)和100%(55/55):经磁珠富集细菌后痰涂片萋尼染色法和荧光染色法的敏感度分别为69°(5174)和72%(53/74),特异度分别为98%(54/55)和95%(52/55):③综合两种培养方法,直接痰涂片萋-尼染色法和荧光染色法的敏感度为40%(32/80)和45%(36/80),特异度分别为100%(49/49)和100%(49/49);经磁珠富集细菌后痰涂片萋-尼染色法和荧光染色法的敏感度分别为65%,(52/80)和70%(56/80)特异度分别为100%(49,/49)和98%(48/49)。结论:使用相同的涂片方法,LED荧光显微镜的涂片阳性检出率优于光学显微镜检查;相比于直接痰涂片法,对痰液中的分枝杆菌进行磁珠法富集处理后涂片镜检阳性率有明显提高(P<0.05);磁珠富集细菌法结合LED显微镜检查,在所有方法中获得最高的阳性检出率。目的了解MDR-TB临床分离株中吡嗪酰胺的药物敏感性,以及吡嗪酰胺(PZA)耐药相关基因pncA和rpsA的突变情况,分析其与耐PZA之间的关系。方法收集142株MDR-TB临床分离株,应用吡嗪酰胺耐药试剂盒(BD公司,美国)测定菌株对吡嗪酰胺的药物敏感性,并通过聚合酶链式反应-测序技术测定菌株pncA和rpsA基因序列,结果与结核分枝杆菌标准株H37Rv的对应序列进行比对,结合突变位点所对应的氦基酸序列进行结果分析,了解基因突变情况。结果142株MDR-TB临床分离株中,PZA耐药菌株占43%(61/142),PZA敏感菌株占57%(81/142)。对142株MDR-TB临床分离菌株的pncA和rpsA基因序列与核分枝杆菌标准株H37Rv的对应序列进行比较,pncA基因比对结果显示:61株PZA耐药菌株中,47株出现突变,突变率77%(47/61);81株PZA敏感株中,27株出现突变,突变率33%(27/81)。rpsA基因比对结果显示:61株PZA耐药菌株中,25株出现突变,突变率41%(25/61);81株PZ1感株中,19株出现突变,突变率11%(19/81)。在47株PZA耐药株pncAA基因的突变中,点突变占比72%(34/47),碱基插入占比11%(5/47),碱基缺失占比15%(7/47),联合突变占比2%(1/47);在27株PZA敏感株pncA基因的突变中,点突变占比96%(26/27),碱基缺失占比4%(1/27).在5株PZA耐药株rps4基因的突变中,点突变占比52%(13/25),碱基插入占比12%(3/25).碱基缺失占比24%(6/25),联合突变占比12%(3/25);在19株PZA敏感株rps4基因的突变中,点突变占比79%(15.19),碱基缺失占比16%(3/19),联合突变占比5%(1/19)。结论在北京胸科医院选取的MDR-TB菌株中,吡嗪酰胺的耐药率占43%;吡嗪酰胺耐药性与pncA基因的突变有强相关性,与rpsA基因的突变相关性
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