MALAT1-EZH2-NOTCH1轴对小鼠TBI后血管重塑及神经再生的作用及其机制研究

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目的:  MALAT1在进化上是一种高度保守的长链非编码 RNA(LncRNA),其首先被证明与肺部肿瘤转移相关,机制可能是促进血管生成。最近研究表明,活化的血管系统可通过分泌神经营养因子,例如BDNF、Ang-1和SDF-1α,促进神经再生。本课题研究MALAT1在创伤性脑损伤(TBI)后血管重塑和神经再生中的作用及其机制。  方法2:  第一部分 MALAT1对血管再生的作用及机制研究。  实验一:MALAT1对血管再生的作用研究。  体外实验:在OGD后24小时,通过慢病毒抑制MALAT1后,进行细胞增殖、迁移和血管形成实验。将细胞随机分成2组:OGD+空白对照和OGD+ LV siMALAT1(100 MOI1μl/100μl)。N=4/组。  在体实验:在CCI后第7天,通过腺相关病毒抑制MALAT1后,进行CD31/Brdu和Lectin的免疫组织化学染色。将小鼠随机分为2组:CCI+空白对照和CCI+ AAV siMALAT1(4μl/小鼠)。N=5/组。  实验二:MALAT1对血管再生的机制研究(一)。  在体实验:为了动态检测MALAT1、EZH2和NOTCH1的变化情况,我们在TBI损伤后6小时和第1、3、7、14、21和28天,进行了PCR实验。将小鼠随机分为2组:假手术组和CCI组,N=4/时间点。在CCI后第7天,通过FISH实验对MALAT1进行定位。  体外实验:在 OGD后48小时,也通过 PCR检测了内皮细胞MALAT1的表达水平。将细胞随机分成2组:对照组和OGD组。在OGD后,通过RNA pull-down鉴定MALAT1和EZH2之间的相关性。N=4/组。  生物信息学:通过两种生物信息学软件-RNA-protein interaction和Starbase,进一步预测MALAT1与EZH2之间的关系。  实验三:MALAT1对血管再生的机制研究(二)。  体外实验:在OGD后24小时后,通过过表达EZH2、活化NOTCH1通路,与下调MALAT1联合干预,进行细胞增殖、迁移和血管形成实验。将细胞随机分成3组:OGD+空白对照、OGD+ LVsiMALAT1(100 MOI1μl/100μl)和OGD+ LVsiMALAT1(100 MOI1μl/100μl)+pcEZH2(10μg/100μl))或Jagged-1(1μg/100μl)。N=4/组。  体内实验:在CCI后第7天,通过过表达EZH2、活化NOTCH1通路,联合下调MALAT1双重干预后,进行CD31/Brdu和Lectin的免疫组织化学染色。将小鼠随机分为4组:CCI+空白对照、CCI+AAVsiMALAT1(4μl/小鼠)、CCI+ AAVsiMALAT1(4μl/小鼠)+Jagged-1(1 ng/ml)和CCI+AAVsiMALAT1(4μl/小鼠)+ pcEZH2。N=5/组。  实验四:MALAT1对血管再生的机制研究(三)。  体外实验:抑制MALAT1后,检测EZH2、NOTCH1、HES1的蛋白水平。将细胞随机分成2组:OGD+空白对照和OGD+LVsiMALAT1(100 MOI1μl/100μl)。N=4/组。(HES1为NOTCH1通路下游蛋白)。  体外实验:抑制EZH2后,检测NOTCH1的蛋白水平。将细胞随机分成2组:OGD+空白对照和OGD+ GSK126(100μM)。N=4/组。  体外实验:过表达 EZH2联合下调 MALAT1双重干预后,检测NOTCH1、HES1的蛋白水平。将细胞随机分成3组:OGD+空白对照、OGD+ LV siMALAT1(100 MOI1μl/100μl)和OGD+ LV siMALAT1(100 MOI1μl/100μl)+ pcEZH2(10μl/100μl)。N=4/组。  实验五:通过 MALAT1的核酸抑制剂,验证 MALAT1对血管重塑的作用。  体外实验:在OGD后24小时,通过LNA GampeR抑制MALAT1后,进行细胞增殖、迁移和管腔形成实验。将细胞随机分为2组:OGD+空白对照和OGD+ LNA GampeR MALAT1(100 nmol/L)。N=4/组。  在体实验:在CCI后第7天,通过LNA GampeR抑制MALAT1后,进行CD31/Brdu和Lectin的免疫组织化学染色。将小鼠随机分为2组:CCI+空白对照和CCI+ LNA GampeR MALAT1(2 mg/kg)。N=5/组。  第二部分 MALAT1对神经再生的作用及机制研究。  实验一:MALAT1对神经再生的作用研究。  在体实验:神经干细胞增殖、成神经细胞迁移和神经元增殖是神经再生的重要标志。我们于CCI后第7天,通过AAV抑制MALAT1后,进行免疫组化染色Nestin、DCX/Brdu和NeuN/Brdu,对神经生成进行检测。将小鼠随机分成2组:CCI+空白对照和CCI+AAVsiMALAT1(4μl/小鼠)。N=5/组。  实验二:MALAT1对神经再生的机制研究。  在体实验:在活化NOTCH1通路联合下调MALAT1双重干预后,通过免疫组织化学检测神经再生。将小鼠随机分成3组:CCI+空白对照、CCI+ AAVsiMALAT1(4μl/小鼠)和CCI+ AAVsiMALAT1(4μl/小鼠)+ Jagged-1(1 ng/ml)。N=5/组。  第三部分血管再生对神经再生的作用研究。  实验一:MALAT1-EZH2-NOTCH1通路对SDF-1α的作用研究。  体外实验:抑制MALAT1后,检测内皮细胞三种分泌因子SDF-1α、Ang1和BDNF的蛋白水平。将细胞随机分成2组:OGD+空白对照和OGD+ LVsiMALAT1(100 MOI1μl/100μl)。N=4/组。  体外实验:过表达 EZH2联合下调 MALAT1双重干预后,检测SDF-1α、Ang1和BDNF的蛋白水平。将细胞随机分成3组:OGD+空白对照、OGD+ LV siMALAT1(100 MOI1μl/100μl)和OGD+ LV siMALAT1(100 MOI1μl/100μl)+ pcEZH2(10μl/100μl)。N=4/组。  体外实验:活化 NOTCH1通路联合下调 MALAT1双重干预后,检测SDF-1α,Ang1和BDNF的蛋白水平。将细胞随机分成3组:OGD+空白对照、OGD+ LV siMALAT1(100 MOI1μl/100μl)和OGD+ LV siMALAT1(100 MOI1μl/100μl)+ Jagged-1(1μg/100μl)。N=4/组。  实验二:SDF-1α对神经再生的作用研究。  在体实验:CCI后第7天,抑制SDF-1α后通过免疫组织化学检测神经再生。将小鼠随机分成2组:CCI+空白对照(生理盐水1 mg/kg)和CCI+ AMD3100(1 mg/kg)。N=5/组。  实验三:MALAT1-SDF-1α轴对神经再生的作用研究。  在体实验:CCI后第7天,使用重组蛋白质 SDF-1α联合下调MALAT1双重干预后,通过免疫组织化学检测神经再生。将小鼠随机分成3组:CCI+空白对照、CCI+ AAVsiMALAT1(4μl/小鼠)和CCI+ AAVsiMALAT1(4μl/小鼠)+ SDF-1α(1 ng/ml/小鼠)。N=5/组。  第四部分 MALAT1对脑血流灌注及神经功能的作用研究。  实验一:MALAT1对脑血流灌注的作用研究。  在体实验:抑制MALAT1后,通过PSI监测血流变化,对脑血流灌注进行评估。将小鼠分成3组:CCI+空白对照、CCI7d+AAVsiMALAT1(4μl/小鼠)和CCI10d+ AAVsiMALAT1(4μl/小鼠)。  实验二:MALAT1对神经功能的作用研究。  在体实验:过表达EZH2联合下调MALAT1双重干预后,通过NSS、抓线测试、Morris水迷宫实验对神经功能进行评估。将小鼠随机分成4组:假手术组、CCI+空白对照、CCI+ AAVsiMALAT1(4μl/小鼠)和CCI+ AAVsiMALAT1(4μl/小鼠)+ pcEZH2(6μl/小鼠)。N=6/组。  实验三:MALAT1对TBI伤灶体积的影响。  在体实验:抑制MALAT1后,通过HE染色对伤灶体积进行检测。将小鼠分成2组:CCI+空白对照和CCI+ AAVsiMALAT1(4μl/小鼠)。N=5/组。  实验四:MALAT1的副作用研究。  在体实验:抑制MALAT1后,通过ELISA检测TBI后急、慢性期炎性细胞因子TNF-α、IL-6和 IL-1β的表达水平。将小鼠随机分成6组:假手术组+空白对照、假手术组+ AAVsiMALAT1(4μl/小鼠)、CCI3d+空白对照、CCI3d+ AAVsiMALAT1(4μl/小鼠)、CCI21d+空白对照和CCI21d+ AAVsiMALAT1(4μl/小鼠)。N=5/组。  由于技术上的限制,目前尚无法构建MALAT1的过表达载体,我们只能通过抑制MALAT1表达,进行反面的理论验证。  结果:  第一部分 MALAT1对血管再生的作用及机制研究。  实验一:体外实验发现,抑制MALAT1后,血管腔管的形成、内皮细胞的增殖受到抑制,但是内皮细胞的迁移增强(P<0.05)。在体实验发现,抑制MALAT1后,CCI后的内皮细胞增殖和功能血管密度也受到明显抑制(P<0.05)。  实验二:在体实验发现,与假手术组相比,CCI后6小时,MALAT1水平明显升高(P<0.05),第14天仍然维持在较高水平(P<0.05)。CCI后,EZH2和NOTCH1的RNA水平变化,显示出与MALAT1相似的趋势。RNA-FISH显示,小鼠脑内存在大量与MALAT1具有免疫反应活性的血管内皮细胞。  体外实验发现,OGD后24小时,内皮细胞中MALAT1水平显著升高(P<0.05)。RNA pull-down实验证明,在内皮细胞中MALAT1可与EZH2相互结合。通过RNA-protein interaction prediction  (http://pridb.gdcb.iastate. edu/RPISeq/)软件预测了MALAT1与RNA结合蛋白之间的结合概率,发现MALAT1结合EZH2的可能性极高(RF或[SVM]分值>0.5)。Starbase软件也提供了类似的证据。这些数据表明在转录水平上,MALAT1可通过表观遗传学调控潜在的靶基因表达。  实验三:体外实验发现,抑制MALAT1联合过表达的EZH2或活化的NOTCH1通路,逆转了siMALAT1介导的抑制内皮细胞增殖、管腔形成和促进细胞迁移作用(P<0.05)。我们在补充实验中也证明,抑制EZH2和NOTCH1通路12小时和24小时后,内皮细胞增殖均受到明显抑制(P<0.05)。  在体实验发现,CCI后MALAT1对内皮细胞增殖和功能血管密度的促进作用,也被过表达 EZH2或激活 NOTCH1信号通路联合MALAT1下调双重干预所逆转(P<0.05)。  实验四:体外实验发现,抑制MALAT1后,内皮细胞中EZH2和NOTCH1的蛋白质水平显著下降(P<0.05)。此外,抑制EZH2后, NOTCH1信号通路亦被抑制(P<0.05)。另外,过表达EZH2联合下调MALAT1,逆转了siMALAT1介导的NOTCH1和HES1抑制效应(P<0.05)。  实验五:体外实验发现,与之前的结果一致,LNA GampeR MALAT1显著抑制管腔形成、内皮细胞增殖,促进了内皮细胞的迁移(P<0.05)。在体实验发现,LNA GampeR MALAT1抑制了小鼠脑的内皮细胞增殖和功能血管密度(P<0.05)。  第二部分 MALAT1对神经再生的作用及机制研究。  实验一:在体实验发现,在CCI后,siMALAT1组的Nestin阳性细胞、BrdU/DCX阳性细胞以及BrdU/NeuN阳性细胞数量较对照组显著减少(P<0.05)。说明MALAT1可促进神经干细胞增殖、成神经细胞迁移和神经元增殖。  实验二:在体实验发现,活化 NOTCH1信号通路联合下调MALAT1,逆转了 MALAT1对神经细胞迁移的促进作用。CCI后, siMALAT1+ Jagged-1组BrdU/DCX阳性细胞数量比siMALAT1组显著增加(P<0.05)。此外,双重干预也逆转了MALAT1对成熟神经元增殖的促进作用。在CCI后,siMALAT1+ Jagged-1组的BrdU/NeuN阳性细胞数量比siMALAT1组也显著增加(P<0.05)。  第三部分血管再生对神经再生的作用研究。  实验一:体外实验发现,抑制MALAT1后,内皮细胞三种分泌因子SDF-1α、Ang1和BDNF中,只有SDF-1α的蛋白水平显著降低(P<0.05)。过表达EZH2联合MALAT1下调,可逆转MALAT1对SDF-1α在的促进作用(P<0.05)。此外,激活NOTCH1通路联合下调MALAT1,亦可逆转MALAT1对SDF-1α的促进作用(P<0.05)。我们在补充实验中证明,抑制EZH2和NOTCH1后,SDF-1α的表达也受到显著抑制(P<0.05)。  实验二:在体实验发现,CCI后AMD3100组的BrdU/DCX阳性细胞数量较对照组显著降低(P<0.05)。另一方面,抑制SDF-1α后,血管内皮周围的DCX阳性细胞数量显著减少(P<0.05),提示神经血管单元数目的减少。  实验三:在体实验发现,使用 SDF-1α重组蛋白和下调 MALAT1的联合干预,逆转了CCI后MALAT1对成神经细胞迁移的促进作用(P<0.05)。荧光实验显示,SDF-1α可由脑血管内皮分泌。此外,SDF-1α重组蛋白联合下调MALAT1,也逆转了MALAT1对神经血管单位的促进作用(P<0.05)。  第四部分 MALAT1对脑血流灌注及神经功能的作用研究。  实验一:在体实验发现,在CCI后第7天和第10天,抑制MALAT1后,损伤区域的脑血流灌注显著降低(P<0.05)。  实验二:在体实验发现,在NSS中,siMALAT1动物组比对照组动物出现更严重的感觉运动功能受损(P<0.05);过表达EZH2可逆转MALAT1对小鼠感觉运动的促进作用(P<0.05)。对于抓线试验, siMALAT1组动物比对照组动物抓持能力显著降低(P<0.05);EZH2过表达也逆转了MALAT1对抓持的促进作用(P<0.05)。最后,Morris水迷宫实验显示,siMALAT1组动物比对照组动物需花费更多的时间来发现隐藏在水里的平台(P<0.05)。在CCI后第20天,相比于对照组动物,siMALAT1组动物的停留时间明显降低、游行的路径长度和穿越平台的次数明显减少(P<0.05)。过表达EZH2逆转了MALAT1介导的促进认知功能效应(P<0.05)。水迷宫实验提示MALAT1可促进小鼠的学习能力和空间记忆能力。  实验三:在体实验发现,与对照组相比,抑制 MALAT1后,TBI造成的伤灶体积并无显著变化(P>0.05)。  实验四:在体实验发现,在脑创伤急、慢性期,与对照组相比, siMALAT1组的三种炎性因子TNF-α、IL-6和 IL-1β均无显著变化(P<0.05)。提示MALAT1并未引起神经炎症等副作用。  结论:  MALAT1可通过EZH2-NOTCH1通路促进血管重塑,随后活化的血管系统增加了SDF-1α的合成。最终促进了TBI后的神经再生和功能恢复。
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