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金银花(Lonicera japonica)是一种具有悠久历史的清热解毒的良药中药材,有着十分广阔的药用价值[1]。我国金银花存在着极为丰富种质资源,但金银花优良品种比较缺乏,且各个地区存在着不同种质混合栽培[2],这大大制约了我国金银花新品种的选育以及国际化推广的发展[3]。本文以昆嵛山金银花天然种群和海阳市金银花人工种群为材料,利用随即扩增多态性DNA(Random Amplified Polymorphic DNA,RAPD)分子标记技术、简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR)扩增技术和叶绿体trnT-trnL及trnL-trnF基因间隔序列分析技术,对供试31个金银花样品进行遗传多样性研究,为金银花良种选育以及道地中药的保护和利用提供建设性建议[4]。研究结果如下:利用RAPD分子标记技术分析了31份金银花样品的遗传多样性及系统发育关系,筛选出的5个条带清晰重复性高且具有较高多态性的引物共扩增出650条带。每个引物可扩增出0-9条带,表明供试31个金银花样品之间具有较高的遗传多样性。利用SPSS软件计算31个金银花样品间的遗传相似性系数和遗传距离,可以发现,样品1与样品31之间遗传距离最远,为2.507;样品25与样品29之间遗传距离最近,为0.020。依据遗传距离进行分析,从而获得31个不同金银花样品间的RAPD系统聚类图,并将31个金银花样品分为两大类。利用SSR分子标记分析了31份金银花样品的遗传多样性及系统发育关系,筛选出的5对重复性好且多态性高的引物共检测到了36个多态性位点,平均每对SSR引物能扩增出7.2个多态性位点,这表明供试的31个金银花样品之间具有较高的遗传多样性,并成功构建31个金银花样品的SSR指纹图谱。基于叶绿体trnL-trnF序列对供试31份金银花样品的遗传多样性和亲缘关系进行了分析。通过对测序得到的序列进行碱基分析可以发现trnL-trnF序列在样品中相当比较保守,适用于研究27个样品之间的系统发育关系。27个样品的扩增序列的聚类图显示样品20、样品28与样品9、样品15、样品16、样品17可以区分为两支,可信度为64%;样品4与样品13、样品21可以区分为两支,可信度为58%;样品7与样品22可以区分为两支,可信度为56%。而样品24、样品25、样品18、样品11、样品8、样品5可以聚为一类,可信度为100%。三种研究方法都表明供试金银花样品具有较高的遗传多样性水平,遗传背景复杂。虽然不同的分析方法得到的结果并不完全一致,但都证实了分子标记技术在金银花资源研究上的高效性和稳定性。