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作物光合同化碳对不同土壤有机碳组分的贡献影响着农田生态系统碳平衡和土壤有机碳的稳定性。为了明确作物源碳在作物-土壤碳库间的转移规律,为认识长江中游玉稻及双季稻模式固碳机制提供科学依据,本研究以玉稻(MR)及双季稻(RR)系统为研究对象,利用13C标记技术及13C自然丰度法,分析了作物源碳在作物-土壤系统中的分配,作物根源碳与秸秆碳对土壤有机碳组分(TOC、DOC、MBC、fPOC、mPOC)贡献的差异及其动态,结果表明:(1)MR模式周年内总固碳量显著高于RR模式,2016年-2017年分别多282 g C/m2、319 g C/m2。回收的13C在标记1天后及早稻收获时在在早稻植株中的分配比分别为99.75%、97.49%。而在早稻收获时回收的13C可向土壤分配2.51%。玉米回收13C在标记1天后与收获时植株13C占比分别为99.42%、98.85%,至玉米收获时向土壤转移了1.15%。(2)RR模式前季作物根源碳对土壤TOC的贡献高于MR模式,其在两季成熟期的贡献率分别高出0.71%、1.03%,贡献量分别多296.00 mg C/kg soil、408.09 mg C/kg soil。RR模式下作物标记秸秆碳对土壤TOC的贡献高于MR模式。早稻标记秸秆对土壤TOC的贡献率及贡献量在晚稻齐穗期显著高出玉米秸秆16.33%及2.14g C/kg soil,但至晚稻收获时早稻标记秸秆碳对土壤TOC的贡献率及贡献量与玉米秸秆差异不显著。总体来看,RR模式下前季作物源碳更易被截留于土壤中。(3)MR模式下前季作物根源碳对土壤DOC的贡献大于RR模式,其贡献率在两季作物收获时分别高出0.26%、1.19%,周年内贡献量比RR模式高5.28 mg C/kg soil。晚稻收获时,MR模式下前季作物根源C对土壤MBC的贡献显著大于RR模式,贡献率及贡献量分别高0.73%和1.66 mg C/kg soil。MR模式下玉米与早稻标记秸秆碳对土壤MBC、DOC的贡献率分别比RR模式显著高4.21%、3.37%其贡献量分别比RR模式高134.91 mg C/kg soil、46.96 mg C/kg soil。可见,MR模式下玉米源碳对土壤活性有机碳组分的影响要大于早稻。(4)RR模式下前季作物根源C对土壤fPOC、mPOC的贡献大于MR模式。周年内RR模式根源C对土壤fPOC、mPOC的贡献率高出MR模式3.76%、2.07%,对土壤fPOC、mPOC的贡献量是MR模式的5.76、4.23倍。玉米标记秸秆碳对后季土壤fPOC及mPOC的贡献率分别比早稻标记秸秆碳的贡献率高出6.21%、0.87%,对后季土壤fPOC及mPOC的贡献量分别比早稻标记秸秆多0.19 g C/kg soil、0.25 g C/kg soil,差异不显著。(5)田间定位2年后,MR与RR模式下土壤TOC、MBC、DOC、fPOC、mPOC等组分碳含量差异不显著。但在2017年晚稻收获时,MR模式与RR模式0-10 cm土壤深度的fPOC、mPOC、TOC的δ13C值均差异显著。根据δ13C自然丰度的变化,据此估算玉米源碳对土壤fPOC的贡献率及贡献量分别为4.13%与172 mg C/kg soil,对mPOC贡献率及贡献量分别为3.76%与606 mg C/kg soil,对TOC的贡献率及贡献量分别为4.96%与810 mg C/kg soil。