【摘 要】
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目的:本研究旨在筛选出结直肠癌（CRC）中氧化应激相关差异表达基因,并寻找与预后相关的关键基因,构建一个可以指导临床实践的预后模型。方法:从癌症基因组图谱（TCGA）中下载结直肠癌的基因表达数据和临床数据,从GeneCards数据库下载氧化应激相关基因。利用R软件对该数据集进行差异表达的氧化应激基因（DEOSGs）筛选并进行GO和KEGG富集分析。使用String网站的资源来构建蛋白质-蛋白质相互
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目的:本研究旨在筛选出结直肠癌（CRC）中氧化应激相关差异表达基因,并寻找与预后相关的关键基因,构建一个可以指导临床实践的预后模型。方法:从癌症基因组图谱（TCGA）中下载结直肠癌的基因表达数据和临床数据,从GeneCards数据库下载氧化应激相关基因。利用R软件对该数据集进行差异表达的氧化应激基因（DEOSGs）筛选并进行GO和KEGG富集分析。使用String网站的资源来构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,并用Cytoscape软件来筛选关键基因。接着通过单因素及多因素Cox回归分析获得相应预后关键基因,并以此构建预后模型。通过风险评分将患者分为高风险及低风险组,运用KaplanMeier生存分析、受试者工作特征曲线（ROC）分析进行模型的内、外部评价。使用多因素Cox回归分析鉴定所建模型能否作为独立的预后因子,最后通过外部的GSE12945队列验证该模型的有效性。结果:通过单因素Cox回归分析初步获得12个与预后相关的氧化应激基因,再经过多因素Cox回归分析最终确定5个基因。构建好预后模型后,通过Kaplan-Meier生存分析发现,低风险组生存时间远大于高风险组（P＜0.001）,且预后模型的1、3、5年的ROC曲线下面积AUC较大。多因素Cox回归分析进一步证实了氧化应激相关基因的独立预后价值,联合临床特征的预后模型ROC曲线下面积为0.629。最后,GSE12945队列也验证了氧化应激相关基因的有效性。结论:成功构建了由5个氧化应激相关基因组成的结直肠癌预后模型,且该模型对于患者预后情况的预测具有一定的价值。
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