microRNA (miRNA)对于哺乳动物骨骼肌的发育及表型差异具有重要的调控作用,它可以在转录后水平,通过阻止翻译或降解mRNA来抑制基因的表达。为了了解决定猪骨骼肌不同表型的分子机制,利用高通量测序技术,针对长白猪(瘦肉型)、通城猪(脂肪型)以及五指山猪(小型猪)三个不同猪种解析其miRNA的表达特征。在长白与通城猪的比较组中,共得到106个差异表达miRNA;在通城及五指山猪的比较组中,共得到151个差异表达miRNA;在长白与五指山猪的比较组中,共得到156个差异表达miRNA。通过靶标预测,并结合已有差异表达mRNA数据,将差异miRNA与差异mRNA进行整合分析,以阐述差异miRNA及相关基因决定肉质性状多样性的分子机制。此外,为了研究骨骼肌发育的分子调控机制,利用高通量测序技术,鉴定并比较分析了出生后0天及成年小鼠骨骼肌miRNA。共得到422个(出生后0天)及336个(成年)已知niRNA。选取log2≥1、p≤0.05的miRNA作为两时期差异表达miRNAo针对差异表达lniRNA,结合已有两时期小鼠骨骼肌转录组数据及靶标预测结果,得到648及892个靶标基因可被差异上调及下调的高丰度miRNA所调控。GO分析的结果表明,候选靶标基因参与细胞周期、黏着、增殖、肌肉发育、血管发育、细胞外基质、Wnt信号通路、p53信号通路、1mTOR信号通路以及VEGF信号通路等生物学过程和信号通路。将与骨骼肌发育及功能相关的生物学过程,结合差异表达miRNA及候选靶标基因绘制网络互作图,解析miRNA调控骨骼肌发育的分子机制。本研究为miRNA对于猪肉质性状与骨骼肌发育的分子调控,以及相关肉质及生长发育的分子标记鉴定提供了重要参考。