肉鸡饲喂蜡样芽孢杆菌后SSH文库的构建及免疫相关基因的筛选和鉴定

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为探究蜡样芽孢杆菌PAS38影响肉鸡免疫的分子机制,将60羽7日龄肉鸡分为2组,对照组饲喂基础日粮,试验组饲喂试含蜡样芽孢杆菌PAS38 1×106 CFU/g的基础日粮;于42日龄时从每个组随机取6只肉鸡,解剖采取脾脏、胸腺和法氏囊,采用SSH技术构建差异基因文库,并对文库进行GO注释,筛选得到免疫相关差异基因;最后利用siRNA技术干扰部分差异基因在肉鸡淋巴细胞中的表达,检测IL-1B、IL-2、IL-6、MYD88、IRF1、TLR4等6个细胞因子mRNA表达水平的变化,对差异基因的功能进行初步分析。结果如下:1.脾脏、胸腺和法氏囊的SSH文库分别得到119条、250条和214条差异基因。2.脾脏、胸腺和法氏囊SSH文库分别筛选到9条、26条和21条免疫相关差异基因。3.脾脏、胸腺和法氏囊免疫相关差异基因中各选取9个基因进行绝对荧光定量验证,其中92.59%的基因拷贝数都显著改变(P<0.05)。4.对肉鸡淋巴细胞中JCHAIN、FTH1、IGF1R、PRDX1、CD3E、TLR7及CDK6等七个差异基因进行干扰试验,相比阴性siRNA对照和空白对照,7个差异基因经过相应siRNA干扰后,其拷贝数都极显著降低(P<0.01)。5.JCHAIN、FTH1、IGF1R、PRDX1、CD3E、TLR7及CDK6等七个差异基因在淋巴细胞中被干扰后,会引起某些细胞因子的显著下调(P<0.05)。结果表明,蜡样芽孢杆菌PAS38饲喂肉鸡后,能够影响其免疫器官中多个基因的表达,蜡样芽孢杆菌PAS38可能通过上调肉鸡免疫器官的某些基因如促生长因子IGF1R和CDK6;与抗原识别,胞内信号转导相关的基因PRDX1、TLR7和CD3E;及与免疫球蛋白和细胞因子生成相关的基因JCHAIN和FTH1;来促进免疫器官发育、淋巴细胞增殖、细胞因子分泌,从而对肉鸡免疫起到调节作用。
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