SLE患者PBMC中lncRNAs的表达及其临床表现相关性研究

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[目的]长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)是一类位于细胞核和(或)细胞质内长度超过200个核苷酸单位且缺乏编码蛋白质功能的功能性RNA分子。它可以在表观遗传水平、转录水平及转录后水平调节基因的广泛参与机体的生理、病理过程。lncRNA在细胞分化及机体的免疫反应中表现出显著的调节作用,随着各种测序技术的发展显著促进了 lncRNA在人类疾病中的研究。在SLE患者中定义与疾病相关的lncRNA有助于建立新的生物标志物和潜在的治疗靶点,同时为进一步研究lncRNA与SLE之间的具体机制及寻找疾病易感基因奠定奠定一定的理论基础。本课题将探索SLE患者外周血单个核细胞(Peripheral blood mononuclear cells,PBMC)中差异性表达的lncRNA并分析其与疾病之间的关系。[方法]本研究分两个组,SLE组(SLE)和健康对照组(NC)。分别收集13例SLE患者和健康参与者空腹外周静脉血20ml,提取两组研究对象PBMC的总RNA后,结合前期高通量测序技术(RNA-seq)及HISAT、String Tie和Blotting分析后筛选出的在SLE患者中差异性表达的linc00861,进一步进行qRT-PCR对linc00861进行进一步验证,并分析其与SLE疾病临床表现的相关性。[结果]1.RNA-seq共分析63677个ensembl gene ID的基因表达矩阵,最后得到11044个有gene symbol的表达矩阵,lncRNA有1584个,我们将该表达矩阵进行对数转化,最后筛选出在SLE患者中显著性差异性表达的lncRMA主要为 linc00861;2.进一步对linc00861进行qRT-PCR验证,结果提示SLE患者(SLE组)较健康对照组(NC组)linc00861的表达水平显著降低,差异具有统计学意义(P<0.05);3.进一步分析SLE患者PBMC中linc00861表达水平与其临床表现的相关性,发现SLE患者PBMC中linc00861的表达水平与SLEDAI积分负相关;尿蛋白阳性的SLE患者linc00861表达水平显著低于尿蛋白阴性的SLE患者;SLE低补体患者linc00861表达水平低于SLE正常补体患者。[结论]SLE患者PBMC中linc00861表达水平显著低于正常对照组,并与疾病活动及肾脏受累程度相关,提示linc00861可能参与SLE的发病,为SLE发病机制的研究提示新的方向,有助于建立新的生物标记和提供潜在的治疗靶点。
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