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Intel ectin是近年发现的一种新型凝集素。哺乳动物的Intelectin在钙离子存在的情况下可以识别细菌细胞壁中含呋喃环的半乳糖,从而在先天免疫系统中发挥作用。目前在文昌鱼和鲑鱼中发现Intelectin可以直接凝集细菌,但其功能机制不清楚。Intelectin功能在不同物种的差异性暗示了Intelectin基因家族的起源、进化过程研究的必要性。为了探索Intelectin基因家族的起源和进化机制,我们在National Center for Biotechnology Information(NCBI)、DOE Jonit Genome Institution(JGI)等数据库中检索了代表性物种的Intelectin,并对其氨基酸序列进行了同源序列比对、进化树分析、motif预测、信号肽预测、等电点、N-糖基化预测等生物信息学分析。氨基酸同源序列比对显示Intelectin基因家族在各物种中高度保守；通过结构域的预测分析,我们只在N-末端发现了FReD结构域,而保守的C末端序列却不匹配Protein Data Bank(PDB)数据库中已有的功能域。motif分析和基因组外显子分析中,我们发现了一段在核酸和蛋白水平上皆保守的区域motif1,3,4,2,5,10,7,6。结合本实验的工作基础和以上的结果,我们将Intelectin分为三部分结构,并分别进行系统进化树分析。我们发现它们的进化树虽有差异,但总体的趋势相似,暗示了这三部分在整体进化的进程上又有各自独特的进化。另外,我们对各物种氨基酸一级序列进行信号肽、糖基化、等电点的预测中,发现Intelectin在物种之间的差异较大,尤其是低等的脊索动物和高等脊椎动物,暗示了Intelectin基因家族在早期功能的多样性。之后我们对具有多拷贝Intelectin的物种进行了进化树分析,发现在这些物种中Intelectin都分为两大支。由于本实验室已得到文昌鱼Amphi71469的克隆,我们尝试克隆了另一分支上的序列Amphi86230,全长912bp,编码302个氨基酸,并构建了pET29b-Amphi86230的表达载体,尝试进行了原核蛋白表达以开展体外功能研究。本论文通过Intelectin基因家族的生物信息学分析,丰富了Intelectin基因家族进化机制的研究,为无脊椎动物向脊椎动物过渡阶段的变化提供了新的线索,同时为Intelectin基因家族的功能研究打下了理论基础。