目的:筛选、克隆甲状腺癌组织与癌旁甲状腺组织的甲基化差异片断。 方法:(1) 应用甲基化敏感性代表性差异分析(methylation-sensitive-representational difference analysis MS-RDA)方法筛选甲状腺癌与癌旁甲状腺组织的甲基化差异片断(2) 克隆、鉴定甲状腺癌与癌旁甲状腺组织的甲基化差异片断,以生物信息学方法进行初步分析。 结果:经过消减杂交筛选出2个低甲基化差异条带,1个高甲基化差异条带。将这些条带克隆后进行测序,其中2个低甲基化条带包含3个低甲基化DNA差异片断,1个高甲基化条带包含5个高甲基化DNA差异片断。经Blastn程序检索GenBank表明,3个低甲基化差异片断分别与BC029276,AL157413.18,AL357073.19基因同源,同源性为99%。5个高甲基化差异片断与GenBank各个数据库同源匹配率在20～35%之间。我们筛选出的差异片断均为新的甲基化差异片断,其中3个低甲基化片断,2个高甲基化片断被NCBI的GenBank数据库收录。 结论:在甲状腺癌组织中存在异常甲基化,筛选出的甲基化差异片断有助于进一步了解异常甲基化在甲状腺癌发生发展中的作用。