甲壳动物免疫系统网络模型的构建与分析

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目前,针对甲壳动物免疫的研究,大多数学者侧重于在免疫刺激剂或环境胁迫下,通过一个或多个免疫指标的免疫反应实验,确定免疫刺激剂对机体的免疫作用。免疫反应是甲壳动物机体整体的反应,其中包括多个免疫路径的单独作用和相互作用,单个免疫指标和路径并不能完整表达机体本身的状态。因此,本文从系统的角度分析问题,整理了近几年相关的文献数据资料,构建了免疫系统网络关系模型,并通过实验数据资料对模型进行了量化,通过量化模型预测免疫系统的未知路径,为免疫实验提供了研究的方向。首先,通过查阅大量的最新文献,搜集了国内外关于甲壳动物免疫的实验结果和实验数据。建立了甲壳动物免疫系统的多条免疫路径:如包囊作用、吞噬作用等;通过不同的反应类型,以流程图的方式简明、直观地展现出来。整理并分析了文章中多种免疫刺激剂的免疫影响作用,并将其标识在特定的免疫路径中,最终得到了全面的免疫系统关系图。其次,运用图论知识,对已得到的免疫系统图进行抽象:将物质或免疫作用抽象为节点,物质之间的免疫反应抽象为边,得到节点网络图。对免疫网络图的性质进行分析表明:免疫网络图中节点的度具有类幂律分布,网络节点的聚集度较低,网络属于稀疏网络;大部分节点的出入度为1,确定了免疫中枢(如酚氧化酶PO等);免疫因子或免疫刺激剂之间存在多种回路,三点作用关系中主要存在正反馈和负反馈等类型,从免疫网络图中发现了具有正反馈和负反馈的免疫回路。最后,对整个甲壳动物免疫网络模型进行了量化与模拟。(1)为解决免疫刺激剂对各路径的影响大小,利用自组织采样原理进行大数据采样;(2)为校核采样数据,根据甲壳动物免疫系统的稳定性,提出了稳定性筛选原则;(3)考虑甲壳动物免疫系统对刺激的敏感性,提出了敏感性筛选原则;(4)根据既有实验结果,提出了实验一致性筛选原则,最后得到了甲壳动物免疫系统的量化模型。应用量化模型,研究了尚未报道的免疫路径,对未来实验的研究方向提供了参考。
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