结肠癌中TET1基因突变体的筛选及功能验证

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DNA羟甲基化是继DNA的甲基化之后发现的又一重要的表观遗传修饰,在基因的表达调控、染色体重塑等方面有着重要功能。TET1(ten-eleven-translocation1,TET1)蛋白作为调控DNA羟甲基化形成的TET家族蛋白的成员之一,可依赖Fe2+和α-酮戊二酸(αKG)催化5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)形成5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethyl-cytosine,5hmC),并可以进一步氧化形成5-醛基胞嘧啶(5-formylcytosine,5fC)和5-羧基胞嘧啶(5-carboxylcytosine,5caC)。TET蛋白与肿瘤的发生有着密切的关系,目前大多数研究表明,TET蛋白家族中的TET2和TET3是一种抑癌基因,而TET1在抑癌基因和癌基因的归属问题上仍存在争议。基因突变是肿瘤发生的重要原因,目前针对TET2的突变研究相对比较透彻,研究发现其在骨髓增生性肿瘤、系统性肥大细胞增生症、慢性骨髓单核细胞性白血病和骨髓增生异常综合征中均存在众多的突变,且部分突变能够影响TET2在细胞内的正常功能,很多研究已经将TET2的突变体作为一种致癌基因,并且利用TET2突变筛查来预测癌症的发生。但TET1突变及对相关生理功能影响迄今鲜有报道,研究TET1在肿瘤中的突变对进一步阐明TET1蛋白在肿瘤发生、发展中的具体作用有重要意义。本文对13例结肠癌组织进行DNA提取,采用针对TET1 11个外显子的特异性引物进行扩增并测序验证。测序结果显示,在13例结肠癌组织中均存在两种TET1错义突变,在mRNA上的突变位置及变化分别为3784 A→G和6749G→A,对应氨基酸位置及变化为I123I→M和2082 E→K。我们利用定点突变试剂盒对TET1质粒进行定点突变,将野生型和突变型的TET1过表达质粒转染到HEK293细胞中,采用Dot blot检测基因组DNA中5hmC的含量,利用Western blot检测细胞内TET1蛋白的表达量。结果显示,单突变6749 G→A和双突变3784 A→G和6749 G→A均能够显著降低TET1催化5mC形成5hmC的能力,并且双突变和单突变之间没有显著的差异。本文对结肠癌中TET1基因的突变进行了分析,并成功筛查鉴定了两个突变位点,本研究对进一步阐明TET1的功能及TET1与肿瘤发生的联系提供重要的参考数据。
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