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猪圆环病毒2型(Porcine circovirus-2,PCV-2)是环状、无囊膜的单股DNA病毒。PCV2和其它病原可以共同引起断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS),是世界上迄今为止发现的最小致病性动物病毒。该病自1991年第一次在加拿大发现之后迅速在全球范围内流行,我国在2000年第一次有该病的报道。PCV2给养猪业造成了巨大的危害,了解其病毒的遗传进化和疫苗的使用效果有利于对其防控。本实验为了调查研究PCV2在规模化猪场的流行情况,在2014至2016年采集疑似患病猪只的内脏及淋巴结,用PCV2的检测引物进行病原的检测,然后在PK-15细胞上进行病毒的分离鉴定。在此期间共在该规模化猪场中分离到8株PCV2病毒,分别命名为GD-1、GD-2、GD-3、GD-4、GD-5、GD-6、GD-7、GD-8。其遗传进化结果显示GD-1、GD-2、GD-3、GD-4、GD-5、GD-7、GD-8,7个分离株同属PCV2b基因型,GD-6属于PCV2a基因型。PCV2病毒全长通常有1767bp和1768bp两种,8株分离株中GD-6为1768bp,其余7株PCV2分离株全长都为1767bp。另外本研究选用10株国内外PCV2病毒作为参考毒株与其分离的8株PCV2病毒进行ORF1、ORF2和全基因组氨基酸同源性分析,结果显示在该规模化猪场中分离到的病毒与国内外参考毒株的全基因组序列同源性在93.0%-98.0%,与各个亚型的参考毒株同源性均较高,说明本猪场中PCV2病毒没有发生较大的遗传变异。PCV2病毒ORF2推导的氨基酸同源性结果显示,本猪场分离株与PCV2c基因型的同源性较低为87.4%-88.5%,另外其分离株和国内外参考毒株不具备地域性质的同源性差异,说明PCV2流行毒株基因型已在世界范围内具有广泛的融合。根据其ORF1编码的Rep蛋白和ORF2编码的Cap蛋白氨基酸位点进行分析,PCV2的Rep蛋白有三个糖基化位点23-25aa(NPS);256-258aa(NQT)和286-288aa(NAT)。三个糖基化位点所在区域均高度保守没有氨基酸位点的改变。另外Cap蛋白氨基酸位点分析结果表明,Cap蛋白是病毒的关键蛋白,在其糖基化位点143-145aa(NYS)没有氨基酸位点的突变,另外发现Cap蛋白上有三个高变区分别位于氨基酸序列的53-90、121-134和190-215位。依据PCV2b基因型毒株的第86-89位点具有特定的识别氨基酸基序SNPR(L),PCV2a基因型毒株特有的识别基序TNKI,可以推断GD-6属于PCV2a,其余七株分离株属于PCV2b基因型,结果与全基因组的系统遗传进化分析相同。Cap蛋白的三维结构结果表明不同基因型和不同亚型的三维结构和抗原位点有较大的差异。本研究调查了该猪场PCV2的流行情况以及毒株遗传进化分析为猪场PCV2的防控提供了参考依据。疫苗免疫是防控PCV2的有效方法,本研究为了评估不同PCV2疫苗免疫效果。在本猪场选用哺乳仔猪120头随机分成三组,分别免疫进口圆环病毒疫苗、国产圆环病毒疫苗及生理盐水,观察保育阶段猪只的各不同疫苗免疫在料肉比、日增重以及发病率等各项指标差异。结果表明进口圆环病毒疫苗免疫组与某国产圆环病毒疫苗免疫组在料肉比分别比对照组降低0.32和0.13,日增重比对照组分别增高60g和12g,说明圆环病毒疫苗免疫可以提高保育阶段猪只的日增重,降低料肉比,降低PCV2的发病率并提高经济效益。