定量蛋白质组学技术在非小细胞肺癌转移机制研究中的初步应用

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肺癌(lung cancer)是全世界范围内发病率和死亡率第一的恶性肿瘤,其中85%为非小细胞肺癌(non-small cell lung cancers,NSCLC)。尽管针对该病的诊断和治疗手段已取得较大进步,但是转移仍是影响肺癌患者5年生存率的重要原因。关于此类疾病真正的发病机理仍旧不清楚,亟待阐明。质谱技术这一新兴的迅速发展的技术,成为肿瘤研究强有力的研究手段。利用2D LC-MS/MS 蛋白质组学平台联合SWATHTM(Sequential Windowed Acquisition of all Theoretical fragment ions,SWATHTM)非标记定量技术分析不同转移潜能的SPC-A-1和SPC-A-lsci细胞系。经二氧化钛亲和富集后,鉴定到154个差异表达的蛋白,其中125个上调,29个下调。通过与Uniprot网站中提供的蛋白信息比对发现,下调中除两个不是磷酸化蛋白外,其余均为磷酸化蛋白,提示磷酸化肽段富集方法的初步建立。利用SWATHTM非标记定量技术鉴定到高转移潜能肺癌细胞系SPC-A-lsci、H1299和低转移潜能肺癌细胞系SPC-A-1、H358之间差异核蛋白共63个,应用实时定量PCR检测8个差异蛋白在mRNA水平的表达情况,结果与质谱结果基本一致。通过查阅文献发现FUBP2具有一定的创新性,故将其作为研究目标,构建其稳定干扰细胞株,体内、体外实验均证明其参与肺癌转移发生的过程,具有潜在研究价值。本实验室前期已报道miR-148a在体内、体外水平均可抑制非小细胞肺癌转移潜能。此研究通过同位素标记相对和绝对定量(isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation,iTRAQ)技术来分析肺癌细胞中miR-148a调控的蛋白图谱,共找到了84个差异蛋白,联合生物信息学分析,为miR-148a抑制肺癌转移机制研究提供了新思路。
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