猪PID1基因的克隆、表达及其与肌内脂肪沉积关系的研究

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随着人们生活水平的提高,猪肉品质已引起了消费者和生产者的广泛重视。遗传基础是改善肉品质的关键。肌内脂肪(IMF)的含量是衡量猪肉品质的一个重要的指标,它对肉的嫩度、多汁性和风味有明显的正效应,目前关于调控猪肌内脂肪沉积的机理还不清楚,主效基因还没有确定。本研究以遗传背景有较大差异的莱芜猪、培育品种鲁莱黑猪、引入品种大白猪为研究对象,对猪磷酸酪氨酸互作结构域1(phosphotyrosine interaction domain containing1, PID1)基因进行了克隆表达分析,旨在为肉质改良的MAS育种筛选有效的分子标记提供理论依据。研究结果如下:以莱芜猪为研究对象,利用兼并引物进行RT-PCR从莱芜猪脂肪和肌肉组织中克隆PID1基因CDS区全序列(已提交NCBI,登录号:GU396255),并对其进行生物信息学分析。结果表明:PID1基因CDS区全长654 bp,编码含217个氨基酸的蛋白,其定位在细胞质,分子量为54kDa,等电点为5.11,蛋白功能预测发现,PID1的C端有一PTB(磷酸酪氨酸作用位点)结构域,与IRS1、SHC中PTB结构域的结构相似,提示可能有相似的功能,在糖和脂肪代谢中发挥重要作用。以莱芜猪为研究对象,应用QRT-PCR技术研究PID1基因在莱芜猪10个不同组织(心脏、背最长肌、脾脏、肝脏、肺脏、小肠、大肠、脑、脂肪、脊髓)的表达谱信息。结果表明:PID1基因在大多数组织中均有表达,其在各组织中的mRNA表达丰度表现为:心脏>脑>肝脏>脂肪>背最长肌>肺脏>脊髓>大肠>脾脏,而在小肠中未见明显表达,推测PID1基因在莱芜猪的生长过程中起到广泛的生物学作用,提示它调节目的基因转录具有广泛性。运用QRT-PCR技术,研究PID1基因在莱芜猪、鲁莱黑猪、大白猪三个猪种的脂肪、背最长肌和肝脏组织中的mRNA表达差异及其与IMF相关性,结果表明:猪品种因素对PID1 mRNA表达量具有显著影响效应(P<0.05),总体表现为:莱芜猪>鲁莱黑猪>大白猪。组织因素对PID1 mRNA表达量具有显著影响效应(P<0.05),总体表现为:肝脏>脂肪>肌肉。品种与组织之间的互作对该基因表达量也具有显著影响效应(P<0.05);对于高IMF(LWH)、中等IMF(LWI)和低IMF(LWL)沉积的3组莱芜猪,IMF沉积因素对PID1 mRNA表达量具有显著影响效应(P<0.05),总体表现为:LWH>LWI>LWL。组织因素对PID1 mRNA表达量具有显著影响效应(P<0.05),总体表现为:肝脏>脂肪>肌肉。莱芜猪的IMF沉积与组织因素之间的互作对该基因表达量也具有显著影响效应(P<0.05);相关分析表明,PID1基因在莱芜猪品种内三个组织中mRNA表达量与IMF含量相关均不显著,而在品种间三个组织中mRNA表达量与IMF含量呈显著正相关(P<0.05)。结果提示:PID1的表达可能与脂肪沉积性状存在一定的关系。
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