结直肠癌化疗及术后的肠道菌群改变研究

来源 :北京大学医学部 | 被引量 : 0次 | 上传用户:woyaoqian115
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目的:结直肠癌(CRC)是经常发生在消化道的肿瘤之一。近年来人们发现肠道微生物失调在该肿瘤的发生发展过程中起到重要作用。本研究拟通过分析健康个体与结直肠癌化疗和外科手术治疗人群的肠道菌群结构变化机制,发现潜在的菌群标志物,为提高CRC治疗的效果、降低化疗耐药率及降低化疗副作用提供一定的临床应用价值。方法:共采集到69例粪便样本,将其分为4组。其中,33例为健康个体(C组),17例为CRC患者(I组),5例已行外科手术治疗CRC患者(IO组),14例已行手术治疗联合术后化疗CRC患者(D组)。记录他们的临床指标后,提取这69个粪便样本的DNA,在Illumina Hiseq2500平台上对16S rRNA V4V5区进行二代高通量测序,并进行生物信息学分析获取肠道微生物群落结构和相对丰度信息,寻找不同组别间的差异菌群。结果:经生物信息学分析,四组样品平均获得1259个OTUs。物种注释结果表明,C、I和D组中主要富集的物种是拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes),但I组、D两组中仍有部分物种失调。相比之下,IO组群落结构发生了巨大变化,占主要优势的物种变成了变形菌门(Proteobacteria)。在种水平上,卵形拟杆菌(B.ovatus)大量存在于健康对照组中,但在结直肠癌患者组和化疗组相对丰度减少,而手术组则没检出。虽然PCoA分析无法显著的将四个组样本各自聚类到一起,但肠道微生物群落Alpha多样性指数Chao值、Shannon指数均高于IO组,表明手术极大地影响了结直肠癌患者的肠道微生物结构。PERMANOVA分析结果也显示组间群落结构差异显著。结论:外科手术对结直肠癌患者的肠道微生物结构影响巨大,IO组的微生物多样性急剧降低,与其他3组相比优势细菌的种类也发生了转变。卵形拟杆菌(B.ovatus)大量存在于健康人体中,但在I组和D组相对丰度减少,而IO组则没检出,这说明该物种可作为结直肠癌诊断和治疗的潜在靶向生物标志物。此外,本研究还找到了其他潜在生物标志物种,包括具核梭杆菌(F.nucleatum)、萨特氏菌属(Sutterella)、殊异韦荣菌(V.dispar)等,这些特殊的微生物或能成为无创诊断结直肠癌的生物标志物。
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