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李是蔷薇科（Rosaceae）李属（Prunus）植物。我国李种质资源极其丰富,品种类型多样。但在长期育种过程中,存在着主栽品种的遗传基础狭窄,遗传基础单一等缺陷,加之有些地方品种本身并无科学名,导致品种资源不仅类型多而且名称乱,同名异物或同物异名现象严重,给种质资源的保存、育种和生产带来极大不便。本研究采用RAPD、SSR及ISSR三种DNA分子标记技术,分别对60份李种质进行了种间亲缘关系鉴定及遗传多样性检研究,以期从DNA水平上评价我国李资源的多样性,明确李品种、种的亲缘关系和分类地位、并区分同物异名、同名异物现象,建立主要品种的DNA指纹图谱,为李核心种质的构建和资源的科学保存提供依据。试验结果表明: （1） 李属植物RAPD最优化反应体系为:总反应体积20μl,10×buffer（20 mMMgSO4,100 mMKC1,80 mM（NH4）SO4,100 mMTris～HCl,0.5%NP-40,pH9.0）2μl,DNA模板80ng,引物浓度0.1μM,dNTP 0.15～0.2 mM,TaqDNA聚合酶为0.5～1.0U,Mg2+2.5～3.0 mM。PCR反应反应热循环程序:预变性94℃,5min;变性94℃,1min;退火39.2～39.8℃,1mim延伸72℃,2min;循环45次;后延伸72℃。 （2） 李属植物ISSR最优化反应体系:总反应体积20μl,10×buffer（20 mMMgSO4,100 mMKCl,80 mM（NH4）SO4,100 mMTris-HCl,0.5%NP-40,pH9.0）2μl,DNA模板20～80ng,引物浓度0.15～0.2μM,dNTP 0.1～0.15 mM,TaqDNA聚合酶为0.5～1U,Mg2+2.5-3.0 mM。反应热循环程序为:预变性94℃,5min;变性94℃,45 s;最佳退火温度50～50.8℃,1min;延伸72℃,1.5mira循环40次。 （3） 根据对60种李属植物材料的RAPD、SSR、ISSR标记研究,聚类结果表明,可将所用李属植物的试材划分为三大类:第一类为杏、杏李杂交种;第二类为中国李系统品种;第三类欧洲李品种;另外,还有其他特殊类型。 （4） 样品间的两两相似系数,用RAPD检测为0.11～0.98,ISSR为0.19～1.00,SSR为0.042～0.98。三种分子标记的多态性均较高,对李种质资源的鉴定效率次序为SSR>RAPD>ISSR。 （5） 获得了RAPD标记中不同材料的24条特异性扩增带,SSR标记中48个特异等位基因,ISSR标记中6份试材的18个特异性扩增带。区分了3份试验材料名称均为香蕉李（8,11,49号材料分属于杏李（P. simonii）,乌苏里李（P. ussuriensis）和中国李（P. salicina））的同名异物材料。