北部湾地处热带和亚热带,为三面陆地环抱的半封闭海湾,是传统的渔场和丰富的生物多样性中心,其中也蕴含着丰富的细菌资源。本研究利用免培养和纯培养技术,对北部湾防城港沿海滩涂来源的5个样区底泥样品（红树林保护区底泥、水域红树林根际底泥、养虾,蟹池塘底泥、珍珠养殖海滩底泥、造纸厂污染海域底泥）进行细菌多样性及与环境因子的关联性分析。通过宏基因组测序分析了解5个样区之间功能基因与抗性基因的丰度及差异性。对分离纯化的菌株进行功能基因及抗菌活性筛选,从而挖掘具有生物活性的潜力菌株。首先,利用细菌16S r RNA基因的高通量测序分析,并结合环境因子差异,了解5个样区的细菌多样性、丰度及与环境因子的相关性。经物种注释后,从样品中检测到丰富的细菌资源,它们分属于50多个门,70多个纲,100多个目,300多个科和1000多个属。在门水平上变形菌门所占比例远远高于其他物种,属于优势物种,且受有机质、钾和盐含量的影响较大。第二,通过宏基因组测序分析,了解5个样区间功能基因及抗性基因的丰度及差异情况。功能基因注释结果显示有大量基因注释到KEGG、egg NOG、CAZy功能数据库的相关功能中,在KEGG中,注释到Metabolism的基因丰度最高;在egg NOG中,注释到Energy production and conversion的基因丰度最高;在CAZy中,注释到GHs、GTs的基因丰度最高。抗性基因注释结果表明有大量基因注释到抗性基因ARO中,其丰度最高的ARO基因为ade F。第三,利用纯培养技术,选择不同的分离培养基对5个样区底泥样品进行细菌分离,最终分离获得338株细菌,分属于3个门,4个纲,16个目,24个科,39个属。其中包括9株潜在新分类单元,占比2.7%。最后,对纯培养分离获得的338株细菌进行功能基因筛选,从中筛选到123株含有功能基因的菌株,且在7类抗生素相关功能基因Malacidin、Lugdunin、Teixobactin、Leinamycin、Glutarimide、Salinomycin和Diterpenes中所占比例分别为2.1%、0.6%、2.1%、26.3%、7.1%、8.9%和9.2%。对去重复后的141株细菌进行抗菌活性筛选,发现28株菌株表现出抗菌活性,且抗金黄色葡萄球菌、枯草芽孢杆菌、结核分枝杆菌、大肠杆菌、白色念珠菌和黑曲霉的菌株所占比例分别为9.2%、5.7%、14.2%、4.3%、7.8%和5.0%。综上所述,北部湾防城港沿海滩涂样品中含有丰富的细菌资源,大量功能基因及抗性基因,因而能为北部湾天然产物的开发提供丰富的菌种库和基因库,其开发潜力巨大,值得深入研究。