拟南芥与水稻中组蛋白甲基化识别蛋白的结构与功能研究

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开花是植物从营养发育转变为生殖发育的重要过程,受到多种因素的调控。组蛋白的甲基化修饰是花期调控的重要方式之一,阅读蛋白是其发挥功能的重要基础。MRG(MORF4-related gene)蛋白家族是人和酵母中组蛋白H3第36位赖氨酸的三甲基化(H3K36me3)的阅读蛋白,而植物中MRG蛋白的研究还很有限。SDG8是拟南芥中H3K36的甲基转移酶,同时其CW结构可识别H3K4的甲基化修饰,对于SDG8关联两种组蛋白修饰的分子机制目前还不清楚。我们以拟南芥与水稻中的MRG蛋白及拟南芥SDG8为重点,在功能与结构方面对这些阅读蛋白展开研究。  我们体外鉴定了拟南芥中MRG1/2蛋白与水稻中MRG701/702蛋白的chromodomain(CD)结构域对组蛋白修饰H3K36me3和H3K4me3的特异性识别,并解析了MRG2CD蛋白与MRG701CD蛋白的晶体结构。在晶体中,MRG2CD与MRG701CD均形成同源二聚体,且在溶液状态也存在。序列比对发现MRGCD二聚体的形成是植物中所特有的。我们的工作发现了植物MRG蛋白特有的聚集状态并揭示了MRG蛋白在染色质水平上可能存在的多种识别机制。  本论文的另一部分工作包括体外验证了拟南芥SDG8的CW结构域对组蛋白H3K4位点的不同甲基化水平的特异性识别,并解析了CW结构域与组蛋白肽段H3K4me1的复合物晶体结构。通过结构分析与体外相互作用测定等实验阐明了SDG8的CW结构域特异性识别H3K4me1的分子机制,为SDG8的功能研究提供了新的研究视角及分子基础。
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