【摘 要】
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该实验室利用紧靠南海这一地理优势,建立了文昌鱼卵巢、文昌鱼神经胚、文昌鱼消化道、海马、水母、赤魟等十几个海洋生物cDNA文库,并完成了这些文库绝大部分EST的测序工作.随
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该实验室利用紧靠南海这一地理优势,建立了文昌鱼卵巢、文昌鱼神经胚、文昌鱼消化道、海马、水母、赤魟等十几个海洋生物cDNA文库,并完成了这些文库绝大部分EST的测序工作.随着cDNA序列的急速增加,人工分析变得越来越困难,针对这些问题,该文建立了一个完全基于SGI超级计算机的cDNA分析系统(CSAS).该文还应用CSAS对整个文昌鱼(Branchiostoma belcheri tsingtauense)cDNA文库进行了比较基因组研究.文昌鱼是一种头索动物,有着非常重要的进化地位,它是无脊椎动物向脊椎动物的中间过渡类型.文库中共有5070条序列,序列的平均GC含量是0.494,对NTG密码子有偏好.将文库中序列长度大于50个氨基酸的蛋白序列4057条分列与线虫(Caenorhabditis elegans)、海鞘(Cions intestionalis)、河豚鱼(Fugu rubripes)、家鼠(Musmusculus)以及人(Homosapiens)的蛋白组序列进行同源性分析,发现与文昌鱼保守序列同源的序列在线早中是2946条,海鞘是3615条,河豚鱼是5701条,大鼠是7575条,人是7092条.因为在物种的进化过程中有两次染色体重复所以从海鞘到河豚鱼、从河豚鱼到大鼠序列的数目才会有巨大的变化.从直系同源的同一性来看,文昌鱼与海鞘(尾索动物)是52.3﹪,而文昌鱼与河豚鱼(硬骨鱼动物)是56.2﹪,这说明了两种可能:(一)在进化过程中自然环境从海鞘到文昌鱼比文昌鱼到河豚鱼来的大;(二)在进化位置上,文昌鱼更靠近河豚鱼.
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