全基因组选择信号揭示绵羊毛囊发育及脱毛性状相关的候选基因

来源 :甘肃农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chris916
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
绵羊作为重要的家畜,其被毛是毛纺织工业的主要原料,根据被毛特征可划分为细毛型绵羊、中毛型绵羊、粗毛型绵羊和无绒毛型绵羊四种类型。羊毛类型主要受毛囊结构、基因调控及其生长发育之间的差异等因素影响。随着市场需求和剪毛成本的变化,羊毛价值与剪毛成本之间呈现出收支失衡的现象,通过挖掘脱毛性状相关基因培育无需剪毛的肉羊新品种,目前已成为研究关注的热点问题。但关于控制绵羊脱毛性状的遗传机制尚不清楚,亟需开展绵羊脱毛性状形成的分子机制研究,为培育具有脱毛性状的肉羊新品种提供理论依据和技术支撑。高通量测序技术与生物信息学的快速发展,诸多研究表明选择信号分析可鉴定出家畜在选择过程中基因组上留下的痕迹,不仅有助于挖掘经济性状相关的关键候选基因,而且可以解释其背后的遗传机制,为肉羊新品种培育及绵羊脱毛性状的潜在分子遗传标记提供基础研究。本研究以无绒毛型和细毛型两种类型的27个品种共795只绵羊为研究对象,利用微阵列基因分型数据基于PCA、进化树和ADMIXTURE三种方法进行遗传背景分析,结果表明795只绵羊主要分为细毛型绵羊和无绒毛型绵羊两个群体,且遗传距离较远;各群体内不同品种之间差异不明显,遗传距离较近,与地理区域和性状特征相符。利用Fst、θπRatio和XPEHH三种方法对两种羊毛类型的绵羊群体进行选择信号分析,将Fst和θπRatio的top 5%以及XPEHH<-2的突变位点作为受强烈选择的SNPs位点并进行注释,结果表明PRX、SOX18、TGM3和TCF3等基因与毛囊形成、表皮分化以及毛囊干细胞发育相关,其中PRX基因第7外显子(14-48786396)上存在非同义G/A突变,导致编码的第387位氨基酸由天冬氨酸(N)变为丝氨酸(S),使PRX基因m RNA二级结构发生变化。选择PRX基因通过Real time-PCR实验进一步验证,结果表明PRX基因在无绒毛羊与细毛羊体侧皮肤组织间表达无明显差异,但PRX基因第7外显子(14-48786396)G/A突变,导致所编码的氨基酸和m RNA二级结构的变化可能会造成PRX蛋白生物学作用发生改变,可能对绵羊羊毛的生长发育产生影响,这将为进一步研究绵羊脱毛性状形成的分子机制提供理论依据。
其他文献
为了比较藏绵羊不同部位骨骼肌的肉品质特性及其与相关基因的关联性,选取繁育在青海省海晏县的3岁成年藏绵羊母羊3只开展试验观测。在分析臂三头肌(Arm triceps)、冈上肌(Supraspinatus)、股四头肌(Quadriceps femoris)、背最长肌(Longissimus dorsi)、腰大肌(Psoas major)、胸斜方肌(Trapezius thoracalis)和腓肠肌(G
学位
高原环境中家畜睾丸功能正常是维持繁殖活动的重要保障,低温、低气压、低氧等生态因子会引起家畜的器官组织结构、细胞凋亡机制、微血管形态等发生一系列的改变,甚至基因表达信号通路的调控方式也可能出现适应性改变。目前,对高原家畜心血管系统、呼吸系统、皮肤被膜等组织中有关低氧适应的细胞生理和调节机理的研究较多也比较系统,但关于藏绵羊生殖器官的低氧适应机理,特别是组织学特征、有关基因的信号通路及其表达特征等的研
学位
<正> 骨髓检查是临床上重要诊断方法之一。早在1927年,Seygath氏首先应用环锯术从胸骨中检查原虫,这种常用的穿刺抽吸所作的涂片,一般能满足临床上需要,但有时取材不满意,如干抽或涂片不能诊断时,则须进一步穿刺活检取到完整组织,方能明确诊断。1960年Pearson用Silverman型针为婴儿作骨髓穿刺活检。国内1963年霍笑足等以Silverman型针代替环锯术作骨髓活检,但须作二次穿刺涂
期刊
反刍动物瘤胃被认为是自然界中微生物定植密度最高的生态系统之一,在机体营养物质的吸收、转化、分配以及宿主神经、免疫调节等诸多方面发挥着重要的作用。剩余采食量是衡量动物饲料效率的重要指标,而绵羊瘤胃微生物与剩余采食量的关系尚不明确。本研究测定了1150只80~180日龄湖羊公羔的剩余采食量(residual feed intake,RFI)、饲料转化率(feed conversion ratio,FC
学位
为合理开发藜麦饲料化利用价值,本试验研究了藜麦单一饲用和牛至精油协同藜麦饲用对芦花鸡生长性能、屠宰性能、肉品质、肉质相关基因、肠道组织形态及盲肠微生物的影响,以期为藜麦籽实与牛至精油在家禽生产中的推广利用提供理论依据。本研究包含两部分:试验一:为研究饲粮中不同藜麦(Chenopodium quinoa)添加比例对芦花鸡(Gallus domestiaus)生长性能、屠宰性能、肉品质、肉质相关基因、
学位
青藏高原具有高寒、低氧、强紫外线、营养物质供给严重失衡的特殊环境因子,而藏绵羊在青藏高原恶劣环境下不仅能够维持机体基础代谢和种群繁衍,还为当地牧民提供毛、皮、肉和燃料等生活资料,这与它们特殊的高原适应性有关。而限制藏绵羊高原适应性的主要因素为寒冷和营养胁迫。因此,本研究基于藏绵羊瘤胃发酵功能、瘤胃液酶活性以及瘤胃上皮组织营养吸收和屏障相关基因表达等基础数据,结合瘤胃微生物组、代谢组和转录组多角度去
学位
随着人们生活水平的提高,对羊肉的需求量逐年增加,对羊肉品质的要求也越来越高。目前人们对高品质羊肉的需求和生产相矛盾,通过杂交育种可有效改善羊肉品质及产量。小尾寒羊作为地方优良品种,以高繁殖力著称,但其产肉率较低。萨福克具有生长发育快、肉质好等特点。因此通过萨福克羊和小尾寒羊杂交,探究其子代生产性能和肉品质的变化将有助于为绵羊育种提供基础数据。同时从分子水平筛选参与调控绵羊生长发育和肉品质相关基因,
学位
遗传背景对牛肉肉品质有很大影响。平凉红牛是以早胜牛为基础母牛,经南德温牛等品种长期杂交改良形成的一个地方肉用群体,其眼肌在大理石花纹、脂肪沉积及风味口感等方面与日本和牛接近,远优于西门塔尔牛。为探索肉牛肉品质在转录组学和代谢组学上的响应,本研究选取日龄、体重、体质相近、饲养管理水平相同的平凉红牛、和牛杂交F1代与中国西门塔尔牛各6头,基于前期肉品质差异,进一步对其背最长肌进行转录组测序和非靶向代谢
学位
动物体内脂肪组织影响其健康状况,饲料利用率和产品品质等生产性能。脂肪细胞是构成脂肪组织的基本功能单位。脂肪沉积包括脂肪细胞的增殖、分化和凋亡过程,涉及众多基因和转录因子等调控。Krüppel样因子7(Krüppel-like factor 7,KLF7)和母亲DPP同源物3(drosophila mothers against decapentaplegic protein 3,Smad3)基因分
学位
精子发生是一个由睾丸微环境调节的复杂而精细的过程,受到许多基因在多个层面(表观遗传、转录、转录后、翻译、翻译后等)的精密调控。睾丸微环境由SCs、LCs、血管、生长因子和细胞因子等组成。BMP4和BMP6是BMPs的成员,作为TGF-β信号通路的上游基因,能够促进细胞的DNA合成和细胞增殖。SMAD5是其下游信号介质,可以抑制细胞凋亡,三者在雄性动物生殖过程中起着关键作用。为了研究BMP4/6和S
学位