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生长抑素受体(SOMATOSTATIN RECEPTOR,SSTR)是细胞膜上的一类7螺旋跨膜结构的蛋白质。种系发生上属于G-蛋白偶联受体(G-PROTEIN COUPLED RECEPTOR,GPCR)家族。GPCR家族的蛋白均为跨膜结构蛋白,由于膜蛋白分离与纯化在目前情况下很困难,因此,现在PDB数据库中已知的晶体结构并不多。SSTR目前在PDB中没有结构的录入。由于GPCR结构的规则性及跨膜区的序列保守性较强,这就为利用GPCR家族蛋白分子的之空间的三维结构的比较分子模拟,(comparative molecular modelling)或称同源模建,(HOMOLOGY MODELING)提供了很好的基础,目前,这是同源模建应用得最为成功的领域之一。本文的目的之一即是通过同源模建的方法,模拟SSTR的三维结构,为研究生长抑素与其受体作用方式提供基础。同时也为以SSTR作为靶标的药物设计提供一个结构基础。本文的基本操作过程是:分别先以五种SSTR的氨基酸序列作为搜寻提问,以Blast2软件和BLOSUM62矩阵作为打分方式,搜寻PDB中满足同源模建条件的已有晶体结构作为模板。然后使用整合在SWISSPROT-MODEL中的PROMODⅡ程序,以所选定的晶体结构为模板进行结构模拟,能量优化采用VAN GUNSTERN等开发的GROMOS96程序,选取的参数为IFP43B1,拓朴文件为MTB4381,采用200个循环的最陡下降法(Steepest descent)和300个循环的共轭梯度法(Conjugate gradient)两种手法,得到能量最小的构象。最后使用RAMACHANDRAN PLOT,氨基酸残基与侧链、主链碰撞等情况来检验模型的质量。结果,得到SSTR受体的全部5种亚型的结构模型。计算模型的最终能量,RAMACHANDRAN PLOT的二面角值,检查氨基酸残基碰撞情况,结果表明,除SSTR2的情况较差外,其余4种模型的可信度都很高。可以认为,以同源模建方法模拟SSTR结构是可行,有效的。本文的另一个目的是以分子对接的方法研究SSTR与其配体相互作用的方式。分子对接(Molecular Docking)是指两个或多个分子之间按照一定的规则相互识别,并以非共价方式结合的过程,通常在计算机辅助药物设计中所说的分子对接,是指以计算机系统,根据几何匹配和能量匹配的原则,来计算模拟两个分子结合的过程。本文使用了一套蛋白质-蛋白质对接软件包GRAMM,对接的方法为最大化的对两个蛋白质的分子进行几何形状及能量匹配,以预测复合物的结构。对接后的复合物模型,以同样的方式进行能量优化,得到最终与结合位点的结构图。结果表明,可能的活性位点由第二胞外环区Phe116第三胞外环区Cys182,IleI184,Phe197,Thr201及第四胞外环区的Val288,构成了一个疏水性的口袋,另外,第二胞外环区的Asn114和第三胞外环区Thr201参与了与OCTREOTIDE的静电作用形成,OCTREOTIDE上的Trp4的芳环,与Phe197的苯环平行,也产生了一个较弱的π-π键。最后,本文以固相合成的方式,合成了生长抑素-14及一种经过序列改造的新的类似物(序列为:ala-[cys-lys-trp-lys-phe-thr-ser-cys])。α-氨基选择以Fmoc方式保护;固相载体为WANG树脂;缩合剂选择BOP族的HBTU。肽链从树脂上的裂解选择TFA。以DMSO氧化将链中的两个CYS形成一个二硫键桥。最后以质谱,氨基酸分析等手段进行了结构确认。结果表明,所合成的两条多肽链的分子量及氨基酸组成成分都是正确的。