股东查阅权和公司商业秘密权在诸多方面有所冲突,在实务中,为避免其商业秘密受到侵犯,公司多以股东查阅具有不正当目的为由拒绝,权利冲突进而出现。怎样解决权利冲突,本文试图对两种权利进行分析,探讨其冲突的实质、表现形式和原因,针对股东查阅权制度提出一些立法建议,以期协调二者冲突,维护股东利益和公司利益。本文首先从股东查阅权和公司商业秘密权的含义出发,对查阅权在自益权或共益权、固有权或非固有权、单独股东权或少数股东权性质问题上进行分析,对商业秘密的性质进行界定,认定商业秘密权具有知识产权的属性。其次,通过分析权利冲突相关问题,结论是利益和价值的冲突乃权利冲突的实质,查阅权和商业秘密权在冲突上主要表现为权利客体、法律原则和行权上的冲突,而两种权利冲突的原因又是法律制度的不完善和价值理念上的差异。最后,在权利平等保护原则和利益、价值平衡原则的协调下,针对法律未涉及的问题提出优化股东查阅权的立法建议,具体是明确查阅权主体、细化委托代理人查阅方式、完善查阅权行使程序,最终达到协调二者的目的。