本文以西安市饮用水源水(黑河)、纳污河水(浐河)、城市景观水(大唐芙蓉园北湖和兴庆湖)以及污水厂二级出水(北石桥污水净化中心)为研究对象，采用不同地点、不同时间间断取样和长期定点连续取样的方法，用传统微生物学检测技术和分子生物学技术，分析包括埃希氏菌、粪大肠菌在内的病原菌在不同水体中的存在情况和分布规律。根据志贺氏痢疾杆菌、霍乱弧菌、沙门氏菌、埃希氏大肠菌四种病原细菌16S rRNA基因的高度保守性设计通用引物，建立起了用定量聚合酶链式反应技术(QPCR)快速检测地表水中病原细菌的方法，该方法能同时检测到包含上述四种病原菌的一大类病原微生物，检测限为25cfu／100mL。该方法快速灵敏，可将DNA提取、扩增、定量分析控制在数小时内完成(其中扩增分析可在2小时内完成)，为地表水病原微生物污染风险评价奠定基础。定量PCR检测结果与传统方法检测到的大肠菌群值表现出良好的相关性，回归分析表明，二者的相关系数为0.93。定量PCR结果为大肠菌群检测结果的2.2～5倍，是粪大肠菌群检测结果的16～34倍。根据地表水环境质量评价标准，结合粪大肠菌群检测结果及QPCR检测结果，对西安市典型地表水体进行微生物污染评价。结果发现，西安市黑河水属于Ⅰ类地表水，病原菌污染风险较小；北湖和兴庆湖属于Ⅱ、Ⅲ类地表水，满足景观娱乐用水A类水质要求，但在人类活动密集的时候，仍然有较高的病原菌含量。浐河水体，粪大肠菌指标可达Ⅱ类、Ⅲ类标准，但QPCR值较高，受其它病原菌污染风险较大；北石桥二级出水粪大肠菌群数在Ⅳ类、Ⅴ类水体中波动，QPCR值也显示出较高的病原菌污染风险。基于QPCR检测结果的病原菌污染评价标准还有待进一步研究。